論文の概要: Foreseeing Brain Graph Evolution Over Time Using Deep Adversarial
Network Normalizer
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2009.11166v1
- Date: Wed, 23 Sep 2020 14:25:40 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2022-10-15 16:37:00.934737
- Title: Foreseeing Brain Graph Evolution Over Time Using Deep Adversarial
Network Normalizer
- Title(参考訳): Deep Adversarial Network Normalizer を用いた時間内脳グラフの進化予測
- Authors: Zeynep Gurler, Ahmed Nebli and Islem Rekik
- Abstract要約: 我々は,脳グラフの正規化を学習する最初のグラフベース生成適応ネットワーク(gGAN)を提案する。
提案手法は, 単一の基準点を用いた脳疾患進展予測誤差の最小化に成功した。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 0.0
- License: http://arxiv.org/licenses/nonexclusive-distrib/1.0/
- Abstract: Foreseeing the brain evolution as a complex highly inter-connected system,
widely modeled as a graph, is crucial for mapping dynamic interactions between
different anatomical regions of interest (ROIs) in health and disease.
Interestingly, brain graph evolution models remain almost absent in the
literature. Here we design an adversarial brain network normalizer for
representing each brain network as a transformation of a fixed centered
population-driven connectional template. Such graph normalization with respect
to a fixed reference paves the way for reliably identifying the most similar
training samples (i.e., brain graphs) to the testing sample at baseline
timepoint. The testing evolution trajectory will be then spanned by the
selected training graphs and their corresponding evolution trajectories. We
base our prediction framework on geometric deep learning which naturally
operates on graphs and nicely preserves their topological properties.
Specifically, we propose the first graph-based Generative Adversarial Network
(gGAN) that not only learns how to normalize brain graphs with respect to a
fixed connectional brain template (CBT) (i.e., a brain template that
selectively captures the most common features across a brain population) but
also learns a high-order representation of the brain graphs also called
embeddings. We use these embeddings to compute the similarity between training
and testing subjects which allows us to pick the closest training subjects at
baseline timepoint to predict the evolution of the testing brain graph over
time. A series of benchmarks against several comparison methods showed that our
proposed method achieved the lowest brain disease evolution prediction error
using a single baseline timepoint. Our gGAN code is available at
http://github.com/basiralab/gGAN.
- Abstract(参考訳): グラフとして広くモデル化された脳の進化は、健康と病気における様々な解剖学的関心領域(ROI)間の動的相互作用のマッピングに不可欠である。
興味深いことに、脳グラフの進化モデルはほとんど文献に残っていない。
本稿では,各脳ネットワークを表す対向型脳ネットワーク正規化器を,固定集中型集団駆動型接続テンプレートの変換として設計する。
固定参照に対するそのようなグラフ正規化は、ベースラインタイムポイントでテストサンプルと最も類似したトレーニングサンプル(すなわち脳グラフ)を確実に識別する方法を舗装する。
テストの進化軌道は、選択されたトレーニンググラフとその対応する進化軌跡にまたがる。
我々は,グラフ上で自然に動作し,そのトポロジ的特性を良好に保存する幾何学的深層学習を基盤とする。
具体的には,固定された結合型脳テンプレート(cbt)に対して,脳グラフの正規化方法を学習するだけでなく,埋め込みと呼ばれる脳グラフの高次表現を学習する最初のグラフベース生成逆ネットワーク(ggan)を提案する。
これらの埋め込みを用いて、トレーニングとテスト対象の類似性を計算することで、ベースラインタイムポイントで最も近いトレーニング対象を選択し、時間とともにテスト脳グラフの進化を予測することができます。
複数の比較方法に対する一連のベンチマークの結果,提案手法が1つのベースラインタイムポイントを用いて,脳疾患発生予測誤差の最小値を得た。
gGANコードはhttp://github.com/basiralab/gGAN.comで公開しています。
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