論文の概要: WHO 2016 subtyping and automated segmentation of glioma using multi-task
deep learning
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2010.04425v1
- Date: Fri, 9 Oct 2020 08:18:53 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2022-10-09 06:16:42.488589
- Title: WHO 2016 subtyping and automated segmentation of glioma using multi-task
deep learning
- Title(参考訳): マルチタスク深層学習を用いたWHO 2016サブタイピングとグリオーマの自動セグメンテーション
- Authors: Sebastian R. van der Voort, Fatih Incekara, Maarten M.J. Wijnenga,
Georgios Kapsas, Renske Gahrmann, Joost W. Schouten, Rishi Nandoe Tewarie,
Geert J. Lycklama, Philip C. De Witt Hamer, Roelant S. Eijgelaar, Pim J.
French, Hendrikus J. Dubbink, Arnaud J.P.E. Vincent, Wiro J. Niessen, Martin
J. van den Bent, Marion Smits, Stefan Klein
- Abstract要約: 我々は1つのマルチタスク畳み込みニューラルネットワークを開発し,IDHの変異状況,1p/19qの同時欠失状態,腫瘍のグレードを予測した。
我々は13の異なる施設から240人の患者を独立したデータセットで分析し、IDH-AUC 0.90, 1p/19q-AUC 0.85, grade-AUC 0.81, mean whole tumor DICE score 0.84を達成した。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 2.8881360490071786
- License: http://arxiv.org/licenses/nonexclusive-distrib/1.0/
- Abstract: Accurate characterization of glioma is crucial for clinical decision making.
A delineation of the tumor is also desirable in the initial decision stages but
is a time-consuming task. Leveraging the latest GPU capabilities, we developed
a single multi-task convolutional neural network that uses the full 3D,
structural, pre-operative MRI scans to can predict the IDH mutation status, the
1p/19q co-deletion status, and the grade of a tumor, while simultaneously
segmenting the tumor. We trained our method using the largest, most diverse
patient cohort to date containing 1508 glioma patients from 16 institutes. We
tested our method on an independent dataset of 240 patients from 13 different
institutes, and achieved an IDH-AUC of 0.90, 1p/19q-AUC of 0.85, grade-AUC of
0.81, and a mean whole tumor DICE score of 0.84. Thus, our method
non-invasively predicts multiple, clinically relevant parameters and
generalizes well to the broader clinical population.
- Abstract(参考訳): グリオーマの正確な特徴は臨床意思決定に不可欠である。
腫瘍のデライン化は、初期決定段階でも望ましいが、時間のかかる作業である。
最新のgpu機能を活用して,3d,構造的,術前のmriスキャンを用いて,腫瘍を分割しながら,腫瘍のidh変異状況,1p/19q共欠状態,グレードを予測可能な,単一のマルチタスク畳み込みニューラルネットワークを開発した。
これまでに16施設のグリオーマ患者1508名を含む最も多種多様な患者コホートを用いて,本法を訓練した。
我々は13の異なる施設から240人の患者を独立したデータセットで分析し、IDH-AUC 0.90, 1p/19q-AUC 0.85, grade-AUC 0.81, mean whole tumor DICE score 0.84を得た。
そこで本手法は,複数の臨床的パラメータを非侵襲的に予測し,より広い臨床集団に適応する。
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