論文の概要: Analysis of the BraTS 2023 Intracranial Meningioma Segmentation Challenge
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2405.09787v1
- Date: Thu, 16 May 2024 03:23:57 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2024-05-17 15:30:35.780946
- Title: Analysis of the BraTS 2023 Intracranial Meningioma Segmentation Challenge
- Title(参考訳): BraTS 2023頭蓋内髄膜腫分節障害の検討
- Authors: Dominic LaBella, Ujjwal Baid, Omaditya Khanna, Shan McBurney-Lin, Ryan McLean, Pierre Nedelec, Arif Rashid, Nourel Hoda Tahon, Talissa Altes, Radhika Bhalerao, Yaseen Dhemesh, Devon Godfrey, Fathi Hilal, Scott Floyd, Anastasia Janas, Anahita Fathi Kazerooni, John Kirkpatrick, Collin Kent, Florian Kofler, Kevin Leu, Nazanin Maleki, Bjoern Menze, Maxence Pajot, Zachary J. Reitman, Jeffrey D. Rudie, Rachit Saluja, Yury Velichko, Chunhao Wang, Pranav Warman, Maruf Adewole, Jake Albrecht, Udunna Anazodo, Syed Muhammad Anwar, Timothy Bergquist, Sully Francis Chen, Verena Chung, Gian-Marco Conte, Farouk Dako, James Eddy, Ivan Ezhov, Nastaran Khalili, Juan Eugenio Iglesias, Zhifan Jiang, Elaine Johanson, Koen Van Leemput, Hongwei Bran Li, Marius George Linguraru, Xinyang Liu, Aria Mahtabfar, Zeke Meier, Ahmed W. Moawad, John Mongan, Marie Piraud, Russell Takeshi Shinohara, Walter F. Wiggins, Aly H. Abayazeed, Rachel Akinola, András Jakab, Michel Bilello, Maria Correia de Verdier, Priscila Crivellaro, Christos Davatzikos, Keyvan Farahani, John Freymann, Christopher Hess, Raymond Huang, Philipp Lohmann, Mana Moassefi, Matthew W. Pease, Phillipp Vollmuth, Nico Sollmann, David Diffley, Khanak K. Nandolia, Daniel I. Warren, Ali Hussain, Pascal Fehringer, Yulia Bronstein, Lisa Deptula, Evan G. Stein, Mahsa Taherzadeh, Eduardo Portela de Oliveira, Aoife Haughey, Marinos Kontzialis, Luca Saba, Benjamin Turner, Melanie M. T. Brüßeler, Shehbaz Ansari, Athanasios Gkampenis, David Maximilian Weiss, Aya Mansour, Islam H. Shawali, Nikolay Yordanov, Joel M. Stein, Roula Hourani, Mohammed Yahya Moshebah, Ahmed Magdy Abouelatta, Tanvir Rizvi, Klara Willms, Dann C. Martin, Abdullah Okar, Gennaro D'Anna, Ahmed Taha, Yasaman Sharifi, Shahriar Faghani, Dominic Kite, Marco Pinho, Muhammad Ammar Haider, Alejandro Aristizabal, Alexandros Karargyris, Hasan Kassem, Sarthak Pati, Micah Sheller, Michelle Alonso-Basanta, Javier Villanueva-Meyer, Andreas M. Rauschecker, Ayman Nada, Mariam Aboian, Adam E. Flanders, Benedikt Wiestler, Spyridon Bakas, Evan Calabrese,
- Abstract要約: 我々はBraTS 2023の頭蓋内髄膜腫チャレンジの設計と結果について述べる。
BraTS髄膜腫チャレンジ(BraTS Meningioma Challenge)は、髄膜腫に焦点を当てた以前のBraTSグリオーマチャレンジとは異なる。
上層部は腫瘍,腫瘍コア,腫瘍全体の拡張のために0.976,0.976,0.964の病変中央値類似係数(DSC)を有していた。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 44.586530244472655
- License: http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
- Abstract: We describe the design and results from the BraTS 2023 Intracranial Meningioma Segmentation Challenge. The BraTS Meningioma Challenge differed from prior BraTS Glioma challenges in that it focused on meningiomas, which are typically benign extra-axial tumors with diverse radiologic and anatomical presentation and a propensity for multiplicity. Nine participating teams each developed deep-learning automated segmentation models using image data from the largest multi-institutional systematically expert annotated multilabel multi-sequence meningioma MRI dataset to date, which included 1000 training set cases, 141 validation set cases, and 283 hidden test set cases. Each case included T2, T2/FLAIR, T1, and T1Gd brain MRI sequences with associated tumor compartment labels delineating enhancing tumor, non-enhancing tumor, and surrounding non-enhancing T2/FLAIR hyperintensity. Participant automated segmentation models were evaluated and ranked based on a scoring system evaluating lesion-wise metrics including dice similarity coefficient (DSC) and 95% Hausdorff Distance. The top ranked team had a lesion-wise median dice similarity coefficient (DSC) of 0.976, 0.976, and 0.964 for enhancing tumor, tumor core, and whole tumor, respectively and a corresponding average DSC of 0.899, 0.904, and 0.871, respectively. These results serve as state-of-the-art benchmarks for future pre-operative meningioma automated segmentation algorithms. Additionally, we found that 1286 of 1424 cases (90.3%) had at least 1 compartment voxel abutting the edge of the skull-stripped image edge, which requires further investigation into optimal pre-processing face anonymization steps.
- Abstract(参考訳): 頭蓋内髄膜腫手術におけるBraTS 2023の設計と成績について述べる。
BraTS Meningioma Challenge は以前の BraTS Glioma Challenge と異なり、髄膜腫に焦点を当てている。
参加する9つのチームは、これまで最大のマルチ機関の専門家による注釈付きマルチラベル型髄膜MRIデータセットのイメージデータを使用して、ディープラーニングの自動セグメンテーションモデルを開発した。
また,T2,T2/FLAIR,T1,T1Gd,T1Gd,T1Gd,T1Gd,T1Gd,T1Gd,T1Gd,T1Gd,T2/FLAIR,T2/FLAIR,T1Gd,T1Gd,T1Gd,T2/FLAIR,T1 Gd,T2/FLAIR,T2/FLAIR,T1Gd,T1Gd,T2/FLAIR,T1Gd,T2/FLAIR,T2/FLAIR,T1Gd,T2/FLAIR,T1Gd,T2/FLAIR,T1Gd,T1Gd ,T2,T1Gd,T1,T1Gd,T1。
ディス類似度係数 (DSC) と95%ハウスドルフ距離 (95%) を含む病変度評価システムを用いて, 参加者自動区分けモデルの評価と評価を行った。
上位分類群では, 腫瘍, 腫瘍コア, 腫瘍全体の増強にそれぞれ0.976, 0.976, 0.964, 対応する平均DSC 0.899, 0.904, 0.871の病変中央値が認められた。
これらの結果は、将来の手術前髄膜腫自動分節アルゴリズムの最先端ベンチマークとして機能する。
さらに,1424例中1286例(90.3%)は,頭蓋骨を張った画像縁の縁に少なくとも1個の分節ボクセルが付着していることが判明した。
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