論文の概要: Automated segmenta-on of pediatric neuroblastoma on multi-modal MRI: Results of the SPPIN challenge at MICCAI 2023
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2505.00369v1
- Date: Thu, 01 May 2025 07:46:03 GMT
- ステータス: 翻訳完了
- システム内更新日: 2025-05-02 19:15:55.260084
- Title: Automated segmenta-on of pediatric neuroblastoma on multi-modal MRI: Results of the SPPIN challenge at MICCAI 2023
- Title(参考訳): マルチモーダルMRIにおける小児神経芽腫のセグメンタオンの自動化:MICCAI 2023におけるSPPINチャレンジの結果
- Authors: M. A. D. Buser, D. C. Simons, M. Fitski, M. H. W. A. Wijnen, A. S. Littooij, A. H. ter Brugge, I. N. Vos, M. H. A. Janse, M. de Boer, R. ter Maat, J. Sato, S. Kido, S. Kondo, S. Kasai, M. Wodzinski, H. Muller, J. Ye, J. He, Y. Kirchhoff, M. R. Rokkus, G. Haokai, S. Zitong, M. Fernández-Patón, D. Veiga-Canuto, D. G. Ellis, M. R. Aizenberg, B. H. M. van der Velden, H. Kuijf, A. De Luca, A. F. W. van der Steeg,
- Abstract要約: 小児神経芽腫 (SPPIN) の手術計画がMICCAI 2023で実施された。
上位チームはDiceのスコア0.82、HD95のスコア7.69mm、VSのスコア0.91を記録した。
上位のチームは大規模な事前トレーニングネットワークを使用して、事前トレーニングが小さな異種データセットで使用できることを示唆している。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 0.0
- License: http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
- Abstract: Surgery plays an important role within the treatment for neuroblastoma, a common pediatric cancer. This requires careful planning, often via magnetic resonance imaging (MRI)-based anatomical 3D models. However, creating these models is often time-consuming and user dependent. We organized the Surgical Planning in Pediatric Neuroblastoma (SPPIN) challenge, to stimulate developments on this topic, and set a benchmark for fully automatic segmentation of neuroblastoma on multi-model MRI. The challenge started with a training phase, where teams received 78 sets of MRI scans from 34 patients, consisting of both diagnostic and post-chemotherapy MRI scans. The final test phase, consisting of 18 MRI sets from 9 patients, determined the ranking of the teams. Ranking was based on the Dice similarity coefficient (Dice score), the 95th percentile of the Hausdorff distance (HD95) and the volumetric similarity (VS). The SPPIN challenge was hosted at MICCAI 2023. The final leaderboard consisted of 9 teams. The highest-ranking team achieved a median Dice score 0.82, a median HD95 of 7.69 mm and a VS of 0.91, utilizing a large, pretrained network called STU-Net. A significant difference for the segmentation results between diagnostic and post-chemotherapy MRI scans was observed (Dice = 0.89 vs Dice = 0.59, P = 0.01) for the highest-ranking team. SPPIN is the first medical segmentation challenge in extracranial pediatric oncology. The highest-ranking team used a large pre-trained network, suggesting that pretraining can be of use in small, heterogenous datasets. Although the results of the highest-ranking team were high for most patients, segmentation especially in small, pre-treated tumors were insufficient. Therefore, more reliable segmentation methods are needed to create clinically applicable models to aid surgical planning in pediatric neuroblastoma.
- Abstract(参考訳): 手術は、一般的な小児がんである神経芽腫の治療において重要な役割を担っている。
これは、しばしばMRI(MRI)ベースの解剖学的3次元モデルを通して、慎重に計画する必要がある。
しかしながら、これらのモデルの作成には時間がかかり、ユーザが依存することが多い。
小児神経芽腫に対する手術計画(SPPIN)の課題を整理し,この話題の進展を刺激し,多モデルMRIによる神経芽腫の完全自動分節化のためのベンチマークを作成した。
この課題は、チームが診断と化学療法後のMRIスキャンからなる34の患者から78セットのMRIスキャンを受けたトレーニングフェーズから始まった。
最終テストフェーズは、9人の患者の18個のMRIセットから構成され、チームのランキングが決定された。
ランク付けは、Dice類似度係数(Dice score)、Hausdorff距離(HD95)の95%、およびボリューム類似度(VS)に基づいていた。
SPPINチャレンジはMICCAI 2023で開催された。
最終予選は9チームで構成された。
最高レベルのチームは、中央のDiceスコア0.82、中央のHD95の7.69mm、VSの0.91を達成し、STU-Netと呼ばれる大規模なネットワークを利用した。
Dice = 0.89 vs Dice = 0.59, P = 0.01) と診断した。
SPPINは頭蓋外腫瘍学における最初の医学的セグメンテーション課題である。
最高レベルのチームは、大規模な事前トレーニングネットワークを使用して、事前トレーニングが小さな異種データセットで使用できることを示唆している。
成績は高かったが,特に小切開,未治療の腫瘍では小切開が不十分であった。
したがって、小児神経芽腫の手術計画を支援するために、臨床応用モデルを作成するためにより信頼性の高いセグメンテーション法が必要である。
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