論文の概要: A Spatial-Temporal Graph Based Hybrid Infectious Disease Model with
Application to COVID-19
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2010.09077v1
- Date: Sun, 18 Oct 2020 19:34:54 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2022-10-06 03:56:57.600225
- Title: A Spatial-Temporal Graph Based Hybrid Infectious Disease Model with
Application to COVID-19
- Title(参考訳): 時空間グラフに基づくハイブリッド感染症モデルとCOVID-19への応用
- Authors: Yunling Zheng, Zhijian Li, Jack Xin, Guofa Zhou
- Abstract要約: 新型コロナウイルスのパンデミックが進むにつれて、信頼できる予測が政策立案に重要な役割を果たす。
RNNのようなデータ駆動機械学習モデルは、COVID-19のような時系列データに制限がある場合に悩まされる可能性がある。
グラフ構造上にSEIRとRNNを組み合わせることで,学習と予測の精度と効率を両立させるハイブリッド時間モデルを構築する。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 3.785123406103385
- License: http://arxiv.org/licenses/nonexclusive-distrib/1.0/
- Abstract: As the COVID-19 pandemic evolves, reliable prediction plays an important role
for policy making. The classical infectious disease model SEIR
(susceptible-exposed-infectious-recovered) is a compact yet simplistic temporal
model. The data-driven machine learning models such as RNN (recurrent neural
networks) can suffer in case of limited time series data such as COVID-19. In
this paper, we combine SEIR and RNN on a graph structure to develop a hybrid
spatio-temporal model to achieve both accuracy and efficiency in training and
forecasting. We introduce two features on the graph structure: node feature
(local temporal infection trend) and edge feature (geographic neighbor effect).
For node feature, we derive a discrete recursion (called I-equation) from SEIR
so that gradient descend method applies readily to its optimization. For edge
feature, we design an RNN model to capture the neighboring effect and
regularize the landscape of loss function so that local minima are effective
and robust for prediction. The resulting hybrid model (called IeRNN) improves
the prediction accuracy on state-level COVID-19 new case data from the US,
out-performing standard temporal models (RNN, SEIR, and ARIMA) in 1-day and
7-day ahead forecasting. Our model accommodates various degrees of reopening
and provides potential outcomes for policymakers.
- Abstract(参考訳): 新型コロナウイルスのパンデミックが進むにつれて、信頼できる予測が政策立案に重要な役割を果たす。
古典的な感染症モデルSEIR(susceptible-exposed-infectious-recovered)は、コンパクトだが単純化された時間モデルである。
RNN(リカレントニューラルネットワーク)のようなデータ駆動機械学習モデルは、COVID-19のような時系列データに制限がある場合に悩む可能性がある。
本稿では,グラフ構造上にSEIRとRNNを組み合わせることで,学習と予測の精度と効率を両立させるハイブリッド時空間モデルを構築する。
グラフ構造には,ノード特徴(局所時間感染傾向)とエッジ特徴(地理的隣接効果)の2つの特徴を導入する。
ノードの特徴に対して、勾配降下法がその最適化に容易に適用できるように、SEIRから離散再帰(I-equation)を導出する。
エッジの特徴として,隣り合う効果を捉え,損失関数のランドスケープを正規化するためにRNNモデルを設計し,局所最小値が有効かつ堅牢であるようにした。
結果として得られたハイブリッドモデル(IeRNNと呼ばれる)は、米国による新型コロナウイルスの新しいケースデータの予測精度を改善し、1日と7日前の予測で標準時間モデル(RNN、SEIR、ARIMA)を上回っている。
我々のモデルは様々なレベルの再開に対応し、政策立案者に潜在的な成果をもたらします。
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