論文の概要: Automatic Brain Tumor Segmentation with Scale Attention Network
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2011.03188v3
- Date: Wed, 25 Nov 2020 19:16:09 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2022-09-29 05:16:18.166558
- Title: Automatic Brain Tumor Segmentation with Scale Attention Network
- Title(参考訳): スケールアテンションネットワークを用いた脳腫瘍自動分割
- Authors: Yading Yuan
- Abstract要約: マルチモーダル脳腫瘍チャレンジ2020(BraTS 2020)は、マルチパラメトリック磁気共鳴イメージング(mpMRI)で異なる自動アルゴリズムを比較する共通のプラットフォームを提供する
本稿では,異なるスケールで特徴写像から高レベルな意味論を取り入れた,低レベルな細部を取り入れた動的スケールアテンション機構を提案する。
術式はBraTS 2020で提供した369症例を用いて訓練し, 平均Dice similarity Coefficient (DSC) は0.8828, 0.8433, 0.8177, Hausdorff は95%, 5.2176, 17.9697, 13.4298 であった。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 1.7767466724342065
- License: http://arxiv.org/licenses/nonexclusive-distrib/1.0/
- Abstract: Automatic segmentation of brain tumors is an essential but challenging step
for extracting quantitative imaging biomarkers for accurate tumor detection,
diagnosis, prognosis, treatment planning and assessment. Multimodal Brain Tumor
Segmentation Challenge 2020 (BraTS 2020) provides a common platform for
comparing different automatic algorithms on multi-parametric Magnetic Resonance
Imaging (mpMRI) in tasks of 1) Brain tumor segmentation MRI scans; 2)
Prediction of patient overall survival (OS) from pre-operative MRI scans; 3)
Distinction of true tumor recurrence from treatment related effects and 4)
Evaluation of uncertainty measures in segmentation. We participate the image
segmentation challenge by developing a fully automatic segmentation network
based on encoder-decoder architecture. In order to better integrate information
across different scales, we propose a dynamic scale attention mechanism that
incorporates low-level details with high-level semantics from feature maps at
different scales. Our framework was trained using the 369 challenge training
cases provided by BraTS 2020, and achieved an average Dice Similarity
Coefficient (DSC) of 0.8828, 0.8433 and 0.8177, as well as 95% Hausdorff
distance (in millimeter) of 5.2176, 17.9697 and 13.4298 on 166 testing cases
for whole tumor, tumor core and enhanced tumor, respectively, which ranked
itself as the 3rd place among 693 registrations in the BraTS 2020 challenge.
- Abstract(参考訳): 脳腫瘍の自動セグメンテーションは、正確な腫瘍検出、診断、予後、治療計画、評価のための定量的イメージングバイオマーカーを抽出するために必要なステップである。
Multimodal Brain tumor Segmentation Challenge 2020 (BraTS 2020)は、マルチパラメトリック磁気共鳴イメージング(mpMRI)における異なる自動アルゴリズムを比較する共通プラットフォームを提供する。
1)脳腫瘍セグメンテーションMRIスキャン
2)術前mriによる全生存率(os)の予測
3)治療関連効果と真腫瘍再発の鑑別
4)セグメンテーションにおける不確実性の評価。
我々は,エンコーダ・デコーダアーキテクチャに基づく完全自動セグメンテーションネットワークを開発することで,画像セグメンテーションチャレンジに参加する。
異なるスケールの情報をよりよく統合するために,異なるスケールで機能マップから高レベルなセマンティクスに低レベルの詳細を組み込む動的スケールアテンション機構を提案する。
当フレームワークはBraTS 2020の369症例を対象にトレーニングを行い,平均Dice similarity Coefficient (DSC) は0.8828, 0.8433, 0.8177, 95% Hausdorff distance (mm) は5.2176, 17.9697, 13.4298で, 全腫瘍, 腫瘍コア, 造影腫瘍の166症例でそれぞれ5.2176, 17.9697, 13.4298であり,BraTS 2020の693件のうち3位にランクインした。
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