論文の概要: Knowledge transfer across cell lines using Hybrid Gaussian Process
models with entity embedding vectors
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2011.13863v1
- Date: Fri, 27 Nov 2020 17:38:15 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2022-09-20 01:56:09.112858
- Title: Knowledge transfer across cell lines using Hybrid Gaussian Process
models with entity embedding vectors
- Title(参考訳): 実体埋め込みベクトルを用いたハイブリッドガウス過程モデルを用いた細胞間知識伝達
- Authors: Clemens Hutter, Moritz von Stosch, Mariano Nicolas Cruz Bournazou,
Alessandro Butt\'e
- Abstract要約: 生物化学的プロセスを開発するために、多数の実験が実施されている。
既に開発されたプロセスのデータを利用して、新しいプロセスの予測を行い、必要な実験の数を大幅に削減できるだろうか。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 62.997667081978825
- License: http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
- Abstract: To date, a large number of experiments are performed to develop a biochemical
process. The generated data is used only once, to take decisions for
development. Could we exploit data of already developed processes to make
predictions for a novel process, we could significantly reduce the number of
experiments needed. Processes for different products exhibit differences in
behaviour, typically only a subset behave similar. Therefore, effective
learning on multiple product spanning process data requires a sensible
representation of the product identity. We propose to represent the product
identity (a categorical feature) by embedding vectors that serve as input to a
Gaussian Process regression model. We demonstrate how the embedding vectors can
be learned from process data and show that they capture an interpretable notion
of product similarity. The improvement in performance is compared to
traditional one-hot encoding on a simulated cross product learning task. All in
all, the proposed method could render possible significant reductions in
wet-lab experiments.
- Abstract(参考訳): 現在までに生化学プロセスを開発するために多くの実験が行われている。
生成されたデータは一度だけ使用され、開発のための決定を下す。
既に開発されたプロセスのデータを利用して、新しいプロセスの予測を行い、必要な実験の数を大幅に削減できるだろうか。
異なる製品のプロセスは振る舞いの違いを示し、通常、サブセットのみが同じように振る舞う。
したがって、複数の製品にまたがるプロセスデータに対する効果的な学習には、製品のアイデンティティを合理的に表現する必要がある。
ガウス過程回帰モデルへの入力となるベクトルを埋め込み、積の同一性(圏的特徴)を表現することを提案する。
組込みベクトルがプロセスデータからどのように学習できるかを示し、製品類似性の概念を解釈可能であることを示す。
性能改善は、シミュレーションされたクロスプロダクト学習タスクにおける従来のワンホット符号化と比較される。
総じて、提案手法はウェットラブ実験において有意な減少をもたらす可能性がある。
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