論文の概要: Fast and Uncertainty-Aware Directional Message Passing for
Non-Equilibrium Molecules
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2011.14115v3
- Date: Tue, 5 Apr 2022 11:57:23 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2022-09-19 20:04:29.976505
- Title: Fast and Uncertainty-Aware Directional Message Passing for
Non-Equilibrium Molecules
- Title(参考訳): 非平衡分子に対する高速かつ不確実な指向性メッセージパッシング
- Authors: Johannes Gasteiger, Shankari Giri, Johannes T. Margraf, Stephan
G\"unnemann
- Abstract要約: 平衡分子のQM9ベンチマークにおいて、元のDimeNetよりも8倍高速で10%精度の高いDimeNet++モデルを提案する。
第2に、衝突時に小さな分子の歪んだ構成を含む挑戦的なCOLLデータセットを開発することにより、DimeNet++を高反応性分子上で検証する。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 0.0
- License: http://arxiv.org/licenses/nonexclusive-distrib/1.0/
- Abstract: Many important tasks in chemistry revolve around molecules during reactions.
This requires predictions far from the equilibrium, while most recent work in
machine learning for molecules has been focused on equilibrium or
near-equilibrium states. In this paper we aim to extend this scope in three
ways. First, we propose the DimeNet++ model, which is 8x faster and 10% more
accurate than the original DimeNet on the QM9 benchmark of equilibrium
molecules. Second, we validate DimeNet++ on highly reactive molecules by
developing the challenging COLL dataset, which contains distorted
configurations of small molecules during collisions. Finally, we investigate
ensembling and mean-variance estimation for uncertainty quantification with the
goal of accelerating the exploration of the vast space of non-equilibrium
structures. Our DimeNet++ implementation as well as the COLL dataset are
available online.
- Abstract(参考訳): 化学における多くの重要なタスクは反応中に分子を取り巻く。
これは平衡から遠ざかる予測を必要とするが、最近の分子の機械学習の研究は平衡状態や準平衡状態に焦点を当てている。
本稿では,この範囲を3つの方法で拡張することを目的とする。
まず, 平衡分子のqm9ベンチマークにおいて, 元のdimenetよりも8倍高速で10%精度のdimenet++モデルを提案する。
第2に,衝突時の小分子の歪んだ配置を含むcollデータセットの開発により,高い反応性を持つ分子上でdimenet++を検証する。
最後に,不確実性定量化のためのアンサンブルと平均分散推定について検討し,非平衡構造の広大な空間の探索を加速することを目的とした。
私たちのDimeNet++実装とCOLLデータセットはオンラインで利用可能です。
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