論文の概要: White paper: The Helix Pathogenicity Prediction Platform
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2104.01033v1
- Date: Fri, 2 Apr 2021 13:09:11 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2021-04-05 17:48:09.742898
- Title: White paper: The Helix Pathogenicity Prediction Platform
- Title(参考訳): 白書:ヘリックス病原性予測プラットフォーム
- Authors: Bas Vroling and Stephan Heijl
- Abstract要約: ミスセンス病原性予測のためのAIベースのソリューションであるHelixを紹介する。
Helixは、ヒトのミスセンス変異体における病原性の予測のための技術プラットフォームの現状を提示する。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 0.0
- License: http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
- Abstract: In this white paper we introduce Helix, an AI based solution for missense
pathogenicity prediction. With recent advances in the sequencing of human
genomes, massive amounts of genetic data have become available. This has
shifted the burden of labor for genetic diagnostics and research from the
gathering of data to its interpretation. Helix presents a state of the art
platform for the prediction of pathogenicity in human missense variants. In
addition to offering best-in-class predictive performance, Helix offers a
platform that allows researchers to analyze and interpret variants in depth
that can be accessed at helixlabs.ai.
- Abstract(参考訳): 本稿では,ミスセンス病原性予測のためのaiベースのソリューションであるhelixを紹介する。
ヒトゲノムのシークエンシングの最近の進歩により、膨大な遺伝データが利用できるようになった。
これは、遺伝子診断と研究のための労働の負担をデータの収集から解釈へとシフトさせた。
Helixはヒトのミスセンス変異体における病原性の予測のための技術プラットフォームの現状を示す。
helixはクラス最高の予測性能を提供するだけでなく、研究者がhelixlabs.aiでアクセス可能な変種を深く分析し解釈できるプラットフォームを提供している。
関連論文リスト
- SpaRED benchmark: Enhancing Gene Expression Prediction from Histology Images with Spatial Transcriptomics Completion [2.032350440475489]
我々は,26の公開資料から収集した体系的にキュレートされ,処理されたデータベースについて述べる。
また、欠落した遺伝子発現を推測する技術として、最先端のトランスフォーマーベースの補完手法を提案する。
我々の貢献は、これまででもっとも包括的な組織像からの遺伝子発現予測のベンチマークとなっている。
論文 参考訳(メタデータ) (2024-07-17T21:28:20Z) - GenoTEX: A Benchmark for Evaluating LLM-Based Exploration of Gene Expression Data in Alignment with Bioinformaticians [13.837406082703756]
我々は、遺伝子発現データの自動探索のためのベンチマークデータセットであるGenoTEXを紹介する。
GenoTEXは、幅広い遺伝子識別問題を解決するための注釈付きコードと結果を提供する。
我々は、文脈対応計画、反復的修正、ドメインエキスパートコンサルティングを設計したLLMベースのエージェントチームであるGenoAgentsを紹介する。
論文 参考訳(メタデータ) (2024-06-21T17:55:24Z) - BioDiscoveryAgent: An AI Agent for Designing Genetic Perturbation Experiments [112.25067497985447]
そこで,BioDiscoveryAgentを紹介した。このエージェントは,新しい実験を設計し,その結果の理由を明らかにし,仮説空間を効率的にナビゲートし,望ましい解に到達させる。
BioDiscoveryAgentは、機械学習モデルをトレーニングすることなく、新しい実験を独自に設計することができる。
6つのデータセットで関連する遺伝的摂動を予測することで、平均21%の改善が達成されている。
論文 参考訳(メタデータ) (2024-05-27T19:57:17Z) - VQDNA: Unleashing the Power of Vector Quantization for Multi-Species Genomic Sequence Modeling [60.91599380893732]
VQDNAは、ゲノムボキャブラリ学習の観点からゲノムのトークン化を改良する汎用フレームワークである。
ベクトル量子化されたコードブックを学習可能な語彙として活用することにより、VQDNAはゲノムをパターン認識の埋め込みに適応的にトークン化することができる。
論文 参考訳(メタデータ) (2024-05-13T20:15:03Z) - Phylogeny-informed fitness estimation [58.720142291102135]
本研究では, 住民の健康評価を推定するために, フィロジェニーを利用した適合度推定手法を提案する。
以上の結果から, 植物性インフォームドフィットネス推定は, ダウンサンプドレキシケースの欠点を軽減することが示唆された。
この研究は、ランタイム系統解析を利用して進化アルゴリズムを改善するための最初のステップとなる。
論文 参考訳(メタデータ) (2023-06-06T19:05:01Z) - A New Deep Learning and XAI-Based Algorithm for Features Selection in
Genomics [5.787117733071415]
本稿では,ゲノム規模のデータに基づいて特徴選択を行う新しいアルゴリズムを提案する。
慢性リンパ性白血病データセットへの応用の結果は、アルゴリズムの有効性を証明している。
論文 参考訳(メタデータ) (2023-03-29T16:44:13Z) - Machine Learning Methods for Cancer Classification Using Gene Expression
Data: A Review [77.34726150561087]
がんは心臓血管疾患の2番目の死因である。
遺伝子発現は癌の早期発見において基本的な役割を担っている。
本研究は,機械学習を用いた癌分類における遺伝子発現解析の最近の進歩を概説する。
論文 参考訳(メタデータ) (2023-01-28T15:03:03Z) - Scalable Pathogen Detection from Next Generation DNA Sequencing with
Deep Learning [3.8175773487333857]
本稿ではトランスフォーマーネットワークをバックボーンとして利用するディープラーニングベースのソリューションMG2Vecを提案する。
提案手法は,未治療の実際の臨床サンプルから病原体を検出するのに有効であることを示す。
本稿では,メタジェノムをベースとした深層学習による疾患診断のための新しい表現学習フレームワークの包括的評価を行う。
論文 参考訳(メタデータ) (2022-11-30T00:13:59Z) - Improving Faithfulness in Abstractive Summarization with Contrast
Candidate Generation and Selection [54.38512834521367]
モデル非依存後処理技術としてのコントラスト候補生成と選択について検討する。
代替候補要約を生成して判別補正モデルを学習する。
このモデルを使用して、最終的な出力サマリーとして最適な候補を選択する。
論文 参考訳(メタデータ) (2021-04-19T05:39:24Z) - Select-ProtoNet: Learning to Select for Few-Shot Disease Subtype
Prediction [55.94378672172967]
本研究は, 類似患者のサブグループを同定し, 数発の疾患のサブタイプ予測問題に焦点を当てた。
新しいモデルを開発するためにメタラーニング技術を導入し、関連する臨床課題から共通の経験や知識を抽出する。
我々の新しいモデルは、単純だが効果的なメタ学習マシンであるPrototypeal Networkと呼ばれる、慎重に設計されたメタラーナーに基づいて構築されている。
論文 参考訳(メタデータ) (2020-09-02T02:50:30Z) - Recent Advances in Network-based Methods for Disease Gene Prediction [15.625526953844638]
ゲノムワイド・アソシエーション研究(GWAS)による疾患遺伝子関連研究は、研究者にとって困難な課題である。
代替の低コストの疾患遺伝子関連証拠を研究者に提供するため、計算アプローチが実施される。
分子ネットワークは病気の分子間の複雑な相互作用を捉えることができるため、疾患遺伝子関連予測において最も広く使われているデータの一つである。
論文 参考訳(メタデータ) (2020-07-19T14:13:38Z)
関連論文リストは本サイト内にある論文のタイトル・アブストラクトから自動的に作成しています。
指定された論文の情報です。
本サイトの運営者は本サイト(すべての情報・翻訳含む)の品質を保証せず、本サイト(すべての情報・翻訳含む)を使用して発生したあらゆる結果について一切の責任を負いません。