論文の概要: Ovarian Cancer Detection based on Dimensionality Reduction Techniques
and Genetic Algorithm
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2105.01748v1
- Date: Tue, 4 May 2021 20:38:29 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2021-05-06 23:46:52.416716
- Title: Ovarian Cancer Detection based on Dimensionality Reduction Techniques
and Genetic Algorithm
- Title(参考訳): 次元化技術と遺伝的アルゴリズムを用いた卵巣癌検出
- Authors: Ahmed Farag Seddik, Hassan Mostafa Ahmed
- Abstract要約: 正常血清からプロテオミクス癌血清を同定する血清SELDIデータセットが2つあります。
PCA (Principal Component Analysis) と GA (Genetic algorithm) の性能を評価することを選択しました。
GAは特徴選択に有効であり,PCA法よりも癌パターン検出に有用であると考えられた。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 0.0
- License: http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
- Abstract: In this research, we have two serum SELDI (surface-enhanced laser desorption
and ionization) mass spectra (MS) datasets to be used to select features
amongst them to identify proteomic cancerous serums from normal serums.
Features selection techniques have been applied and classification techniques
have been applied as well. Amongst the features selection techniques we have
chosen to evaluate the performance of PCA (Principal Component Analysis ) and
GA (Genetic algorithm), and amongst the classification techniques we have
chosen the LDA (Linear Discriminant Analysis) and Neural networks so as to
evaluate the ability of the selected features in identifying the cancerous
patterns. Results were obtained for two combinations of features selection
techniques and classification techniques, the first one was PCA+(t-test)
technique for features selection and LDA for accuracy tracking yielded an
accuracy of 93.0233 % , the other one was genetic algorithm and neural network
yielded an accuracy of 100%. So, we conclude that GA is more efficient for
features selection and hence for cancerous patterns detection than PCA
technique.
- Abstract(参考訳): 本研究では, 血清seldi (surface-enhanced laser de absorption and ionization) mass spectrum (ms) データセットを用いて, 正常血清からプロテオミクス癌性血清を同定する機能を選択する。
特徴の選択技術が適用され、分類技術も適用されている。
特徴選択手法として,PCA (Principal Component Analysis ) とGA (Genetic Algorithm) の性能評価を選択し,分類手法としてLDA (Linear Discriminant Analysis) とニューラルネットを選択し,癌パターンの同定における特徴の評価を行った。
その結果,特徴選択法と分類法の組み合わせで,第1に特徴選択のためのPCA+(t-test)法,第1に精度追跡のためのLDAが93.0233 %,第2に遺伝的アルゴリズムとニューラルネットワークが100%の精度で得られた。
そこで我々は, GAが特徴選択に有効であり, PCA法よりも癌パターン検出に有用であることが結論された。
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