論文の概要: Multivariate feature ranking of gene expression data
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2111.02357v1
- Date: Wed, 3 Nov 2021 17:19:53 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2021-11-04 12:42:26.342873
- Title: Multivariate feature ranking of gene expression data
- Title(参考訳): 遺伝子発現データの多変量特徴ランキング
- Authors: Fernando Jim\'enez and Gracia S\'anchez Jos\'e Palma and Luis
Miralles-Pechu\'an and Juan Bot\'ia
- Abstract要約: ペアワイズ相関とペアワイズ整合性に基づく2つの新しい多変量特徴ランキング手法を提案する。
提案手法は, クラスタリング変動, チ・スクエアド, 相関, 情報ゲイン, ReliefF および Significance の手法よりも優れていることを示す。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 62.997667081978825
- License: http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/
- Abstract: Gene expression datasets are usually of high dimensionality and therefore
require efficient and effective methods for identifying the relative importance
of their attributes. Due to the huge size of the search space of the possible
solutions, the attribute subset evaluation feature selection methods tend to be
not applicable, so in these scenarios feature ranking methods are used. Most of
the feature ranking methods described in the literature are univariate methods,
so they do not detect interactions between factors. In this paper we propose
two new multivariate feature ranking methods based on pairwise correlation and
pairwise consistency, which we have applied in three gene expression
classification problems. We statistically prove that the proposed methods
outperform the state of the art feature ranking methods Clustering Variation,
Chi Squared, Correlation, Information Gain, ReliefF and Significance, as well
as feature selection methods of attribute subset evaluation based on
correlation and consistency with multi-objective evolutionary search strategy.
- Abstract(参考訳): 遺伝子発現データセットは通常高次元であるため、属性の相対的重要性を特定するための効率的かつ効果的な方法が必要である。
可能な解の検索空間が巨大であるため、属性サブセット評価特徴選択手法は適用できない傾向があるため、これらのシナリオでは特徴ランク付け手法が用いられる。
文献に記載されている特徴ランキング法のほとんどは単変量法であるため,因子間の相互作用は検出されない。
本稿では,3つの遺伝子発現分類問題に適用した,ペアワイズ相関とペアワイズ一貫性に基づく2つの新しい多変量特徴ランキング手法を提案する。
提案手法が,多目的進化的探索戦略との相関と一貫性に基づく属性集合評価の特徴選択手法と同様に,特徴分類手法のクラスタリング変動,chi二乗法,相関法,情報ゲイン法,レリーフ法,重要度を上回っていることを統計的に証明した。
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