論文の概要: Learning Robust Hierarchical Patterns of Human Brain across Many fMRI
Studies
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2105.06535v1
- Date: Thu, 13 May 2021 20:10:00 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2021-05-18 01:50:11.748082
- Title: Learning Robust Hierarchical Patterns of Human Brain across Many fMRI
Studies
- Title(参考訳): 多くのfMRI研究における脳のロバストな階層パターンの学習
- Authors: Dushyant Sahoo, Christos Davatzikos
- Abstract要約: 安静時fMRIは、様々な疾患の分析にサロゲートバイオマーカーを提供することが示されている。
バイオマーカーの統計力と脳の理解メカニズムを改善するために、マルチセンター研究のプールがますます普及しています。
しかし、複数のサイトからデータをプールすることは、ハードウェア、ソフトウェア、環境によるバリエーションをもたらす。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 2.451910407959205
- License: http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
- Abstract: Resting-state fMRI has been shown to provide surrogate biomarkers for the
analysis of various diseases. In addition, fMRI data helps in understanding the
brain's functional working during resting state and task-induced activity. To
improve the statistical power of biomarkers and the understanding mechanism of
the brain, pooling of multi-center studies has become increasingly popular. But
pooling the data from multiple sites introduces variations due to hardware,
software, and environment. In this paper, we look at the estimation problem of
hierarchical Sparsity Connectivity Patterns (hSCPs) in fMRI data acquired on
multiple sites. We introduce a simple yet effective matrix factorization based
formulation to reduce site-related effects while preserving biologically
relevant variations. We leverage adversarial learning in the unsupervised
regime to improve the reproducibility of the components. Experiments on
simulated datasets display that the proposed method can estimate components
with improved accuracy and reproducibility. We also demonstrate the improved
reproducibility of the components while preserving age-related variation on a
real dataset compiled from multiple sites.
- Abstract(参考訳): 静止状態fMRIは、様々な疾患の分析のための代理バイオマーカーを提供する。
さらに、fMRIデータは、休息状態とタスク誘発活動中の脳の機能的働きを理解するのに役立つ。
バイオマーカーの統計力と脳の理解メカニズムを改善するため、多施設研究のプール化が盛んに行われている。
しかし、複数のサイトからデータをプールすることは、ハードウェア、ソフトウェア、環境によるバリエーションをもたらす。
本稿では,複数のサイトで取得したfMRIデータにおける階層的疎結合パターン(hSCP)の推定問題について考察する。
本稿では,生体関連変異を保ちつつ,サイト関連効果を低減できる簡易かつ効果的なマトリックス因子化に基づく定式化を提案する。
我々は,教師なし体制における敵学習を活用し,コンポーネントの再現性を向上させる。
シミュレーションデータセットの実験により,提案手法は精度と再現性を向上したコンポーネントを推定できることを示した。
また,複数のサイトから収集した実際のデータセットの年齢変化を保存しながら,部品の再現性の向上を実証した。
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