論文の概要: Relation Matters in Sampling: A Scalable Multi-Relational Graph Neural
Network for Drug-Drug Interaction Prediction
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2105.13975v1
- Date: Fri, 28 May 2021 16:55:09 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2021-05-31 13:54:38.736206
- Title: Relation Matters in Sampling: A Scalable Multi-Relational Graph Neural
Network for Drug-Drug Interaction Prediction
- Title(参考訳): サンプリングにおける関係性:ドラッグ・ドラッグ相互作用予測のためのスケーラブルなマルチリレーショナルグラフニューラルネットワーク
- Authors: Arthur Feeney and Rishabh Gupta and Veronika Thost and Rico Angell and
Gayathri Chandu and Yash Adhikari and Tengfei Ma
- Abstract要約: 本稿では,グラフニューラルネットワークにおける近傍サンプリングにおける関係型の重要性をモデル化する手法を提案する。
薬物と薬物の相互作用予測実験により、最先端のグラフニューラルネットワークは関係性に依存したサンプリングによって利益を得ることが示された。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 6.685734268578486
- License: http://arxiv.org/licenses/nonexclusive-distrib/1.0/
- Abstract: Sampling is an established technique to scale graph neural networks to large
graphs. Current approaches however assume the graphs to be homogeneous in terms
of relations and ignore relation types, critically important in biomedical
graphs. Multi-relational graphs contain various types of relations that usually
come with variable frequency and have different importance for the problem at
hand. We propose an approach to modeling the importance of relation types for
neighborhood sampling in graph neural networks and show that we can learn the
right balance: relation-type probabilities that reflect both frequency and
importance. Our experiments on drug-drug interaction prediction show that
state-of-the-art graph neural networks profit from relation-dependent sampling
in terms of both accuracy and efficiency.
- Abstract(参考訳): サンプリングは、グラフニューラルネットワークを大規模グラフにスケールするための確立された技術である。
しかし、現在のアプローチでは、グラフは関係の観点で均質であると仮定し、関係型を無視している。
多重関係グラフは、通常、可変周波数を持ち、問題に対する重要度が異なる様々な種類の関係を含む。
本稿では,グラフニューラルネットワークにおける近傍サンプリングにおける関係型の重要性をモデル化し,適切なバランス(周波数と重要性の両方を反映した関係型確率)を学習できることを示す。
薬物と薬物の相互作用予測実験により,最先端のグラフニューラルネットワークは,精度と効率の両面で,関連依存的なサンプリングから利益を得ていることが示された。
関連論文リスト
- Multi-Relational Graph Neural Network for Out-of-Domain Link Prediction [12.475382123139024]
本稿では,領域外一般化問題に対処するため,GOODと呼ばれる新しいグラフニューラルネットワークモデルを提案する。
GOODは、既知の関係タイプから予測を効果的に一般化し、最先端の結果を得ることができる。
論文 参考訳(メタデータ) (2024-03-17T18:08:22Z) - A Comparative Study of Population-Graph Construction Methods and Graph
Neural Networks for Brain Age Regression [48.97251676778599]
医用画像では、人口グラフが有望な結果を示しており、主に分類作業に向けられている。
人口グラフの抽出は非自明な作業であり、グラフニューラルネットワーク(GNN)の性能に大きな影響を及ぼす可能性がある
本研究では,有意義なグラフ構築の重要性を強調し,異なる集団グラフ構築手法による実験を行う。
論文 参考訳(メタデータ) (2023-09-26T10:30:45Z) - Predicting Biomedical Interactions with Probabilistic Model Selection
for Graph Neural Networks [5.156812030122437]
現在の生物学的ネットワークは、ノイズ、スパース、不完全であり、そのような相互作用の実験的同定には時間と費用がかかる。
ディープグラフニューラルネットワークは、グラフ構造データモデリングの有効性を示し、バイオメディカル相互作用予測において優れた性能を達成した。
提案手法により,グラフ畳み込みネットワークは,その深度を動的に適応し,対話数の増加に対応することができる。
論文 参考訳(メタデータ) (2022-11-22T20:44:28Z) - Multi-modal Dynamic Graph Network: Coupling Structural and Functional
Connectome for Disease Diagnosis and Classification [8.67028273829113]
構造的および機能的脳ネットワーク学習のためのマルチモーダル動的グラフ畳み込みネットワーク(MDGCN)を提案する。
本手法は,モーダル間表現のモデル化と動的グラフへの注意的多モデル関連付けの利点を生かした。
論文 参考訳(メタデータ) (2022-10-25T02:41:32Z) - Relation Embedding based Graph Neural Networks for Handling
Heterogeneous Graph [58.99478502486377]
我々は、同種GNNが不均一グラフを扱うのに十分な能力を持つように、シンプルで効率的なフレームワークを提案する。
具体的には、エッジ型関係と自己ループ接続の重要性を埋め込むために、関係1つのパラメータのみを使用する関係埋め込みベースのグラフニューラルネットワーク(RE-GNN)を提案する。
論文 参考訳(メタデータ) (2022-09-23T05:24:18Z) - Learning the Evolutionary and Multi-scale Graph Structure for
Multivariate Time Series Forecasting [50.901984244738806]
時系列の進化的・マルチスケール相互作用をモデル化する方法を示す。
特に、まず、拡張畳み込みと協調して、スケール固有の相関を捉える階層グラフ構造を提供する。
最終的な予測を得るために上記のコンポーネントを統合するために、統合ニューラルネットワークが提供される。
論文 参考訳(メタデータ) (2022-06-28T08:11:12Z) - Graph-in-Graph (GiG): Learning interpretable latent graphs in
non-Euclidean domain for biological and healthcare applications [52.65389473899139]
グラフは、医療領域において、非ユークリッドな非ユークリッドデータをユビキタスに表現し、分析するための強力なツールである。
近年の研究では、入力データサンプル間の関係を考慮すると、下流タスクに正の正の正則化効果があることが示されている。
タンパク質分類と脳イメージングのためのニューラルネットワークアーキテクチャであるGraph-in-Graph(GiG)を提案する。
論文 参考訳(メタデータ) (2022-04-01T10:01:37Z) - Brain dynamics via Cumulative Auto-Regressive Self-Attention [0.0]
深部グラフニューラルネットワーク(GNN)よりもかなり浅いモデルを提案する。
本モデルは,各時系列の自己回帰構造を学習し,有向接続グラフを推定する。
統合失調症患者とコントロールを分類した機能的ニューロイメージングデータセットについて報告する。
論文 参考訳(メタデータ) (2021-11-01T21:50:35Z) - Towards Deeper Graph Neural Networks [63.46470695525957]
グラフ畳み込みは近傍の集約を行い、最も重要なグラフ操作の1つである。
いくつかの最近の研究で、この性能劣化は過度に滑らかな問題に起因している。
本研究では,大きな受容領域からの情報を適応的に組み込むディープ適応グラフニューラルネットワーク(DAGNN)を提案する。
論文 参考訳(メタデータ) (2020-07-18T01:11:14Z) - Graph Structure of Neural Networks [104.33754950606298]
ニューラルネットワークのグラフ構造が予測性能にどのように影響するかを示す。
リレーショナルグラフの"スイートスポット"は、予測性能を大幅に改善したニューラルネットワークにつながる。
トップパフォーマンスニューラルネットワークは、実際の生物学的ニューラルネットワークと驚くほどよく似たグラフ構造を持つ。
論文 参考訳(メタデータ) (2020-07-13T17:59:31Z)
関連論文リストは本サイト内にある論文のタイトル・アブストラクトから自動的に作成しています。
指定された論文の情報です。
本サイトの運営者は本サイト(すべての情報・翻訳含む)の品質を保証せず、本サイト(すべての情報・翻訳含む)を使用して発生したあらゆる結果について一切の責任を負いません。