論文の概要: Automatic CT Segmentation from Bounding Box Annotations using
Convolutional Neural Networks
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2105.14314v2
- Date: Tue, 1 Jun 2021 16:06:47 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2021-06-05 16:02:37.967710
- Title: Automatic CT Segmentation from Bounding Box Annotations using
Convolutional Neural Networks
- Title(参考訳): 畳み込みニューラルネットワークを用いた境界ボックスアノテーションの自動CT分割
- Authors: Yuanpeng Liu, Qinglei Hui, Zhiyi Peng, Shaolin Gong and Dexing Kong
- Abstract要約: 提案手法は,1)k平均クラスタリングによる境界ボックスアノテーションを用いた擬似マスクの生成,2)分割モデルとして3次元U-Net畳み込みニューラルネットワークを反復的に訓練する。
肝臓、脾臓、腎臓のセグメンテーションでは、それぞれ95.19%、92.11%、91.45%の精度を達成した。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 2.554905387213585
- License: http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
- Abstract: Accurate segmentation for medical images is important for clinical diagnosis.
Existing automatic segmentation methods are mainly based on fully supervised
learning and have an extremely high demand for precise annotations, which are
very costly and time-consuming to obtain. To address this problem, we proposed
an automatic CT segmentation method based on weakly supervised learning, by
which one could train an accurate segmentation model only with weak annotations
in the form of bounding boxes. The proposed method is composed of two steps: 1)
generating pseudo masks with bounding box annotations by k-means clustering,
and 2) iteratively training a 3D U-Net convolutional neural network as a
segmentation model. Some data pre-processing methods are used to improve
performance. The method was validated on four datasets containing three types
of organs with a total of 627 CT volumes. For liver, spleen and kidney
segmentation, it achieved an accuracy of 95.19%, 92.11%, and 91.45%,
respectively. Experimental results demonstrate that our method is accurate,
efficient, and suitable for clinical use.
- Abstract(参考訳): 臨床診断には医用画像の正確なセグメンテーションが重要である。
既存の自動セグメンテーション手法は、主に完全に教師ありの学習に基づいており、正確なアノテーションの需要が非常に高く、非常に費用がかかり、時間を要する。
この問題に対処するため,我々は,境界ボックスという形で,弱いアノテーションでのみ正確なセグメント化モデルを訓練できる,弱い教師付き学習に基づくctセグメント化手法を提案した。
提案手法は,1)k平均クラスタリングによる境界ボックスアノテーションによる擬似マスクの生成,2)分割モデルとして3次元U-Net畳み込みニューラルネットワークを反復的に訓練する。
いくつかのデータ前処理手法は性能向上に使用される。
この方法は3種類の臓器を含む4つのデータセットで627個のCTボリュームで検証された。
肝臓,脾臓,腎分画では95.19%,92.11%,91.45%の精度を示した。
実験の結果,本手法は正確で,効率的であり,臨床応用に適していることが示された。
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