論文の概要: Neural message passing for joint paratope-epitope prediction
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2106.00757v1
- Date: Mon, 31 May 2021 16:37:55 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2021-06-03 14:19:33.085300
- Title: Neural message passing for joint paratope-epitope prediction
- Title(参考訳): 関節パラトープ・エピトープ予測のためのニューラルメッセージパッシング
- Authors: Alice Del Vecchio, Andreea Deac, Pietro Li\`o and Petar
Veli\v{c}kovi\'c
- Abstract要約: 抗体は、抗原に結合して抗原を検出し中和する免疫系のタンパク質である。
抗体-抗原相互作用における結合部位の予測は、それぞれパラトープおよびパラトープとして知られ、ワクチンおよび合成抗体発生の鍵となる。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 0.0
- License: http://arxiv.org/licenses/nonexclusive-distrib/1.0/
- Abstract: Antibodies are proteins in the immune system which bind to antigens to detect
and neutralise them. The binding sites in an antibody-antigen interaction are
known as the paratope and epitope, respectively, and the prediction of these
regions is key to vaccine and synthetic antibody development. Contrary to prior
art, we argue that paratope and epitope predictors require asymmetric
treatment, and propose distinct neural message passing architectures that are
geared towards the specific aspects of paratope and epitope prediction,
respectively. We obtain significant improvements on both tasks, setting the new
state-of-the-art and recovering favourable qualitative predictions on antigens
of relevance to COVID-19.
- Abstract(参考訳): 抗体は、抗原に結合して抗原を検出し中和する免疫系のタンパク質である。
抗体と抗原の相互作用における結合部位はそれぞれパラトープとエピトープと呼ばれ、これらの領域の予測はワクチンおよび合成抗体の発達の鍵となる。
先行技術とは対照的に、パラトープとエピトープ予測器は非対称な処理を必要とし、それぞれがパラトープとエピトープ予測の特定の側面に向けられた異なるニューラルメッセージパッシングアーキテクチャを提案する。
両タスクの大幅な改善,新たな最先端の設定,および新型コロナウイルス関連抗原の定性的予測の回復について検討した。
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