論文の概要: Equivariant Graph Neural Networks for 3D Macromolecular Structure
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2106.03843v1
- Date: Mon, 7 Jun 2021 17:57:04 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2021-06-08 17:27:05.301775
- Title: Equivariant Graph Neural Networks for 3D Macromolecular Structure
- Title(参考訳): 3次元高分子構造のための等価なグラフニューラルネットワーク
- Authors: Bowen Jing, Stephan Eismann, Pratham N. Soni, Ron O. Dror
- Abstract要約: 幾何ベクトルパーセプトロンの研究を拡張し、構造生物学から幅広いタスクに等変グラフニューラルネットワークを適用した。
提案手法は,ATOM3Dベンチマークの8つのタスクのうち4つのタスクにおいて参照アーキテクチャよりも優れており,回転不変グラフニューラルネットワークよりも広範囲に改善されている。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 2.064612766965483
- License: http://arxiv.org/licenses/nonexclusive-distrib/1.0/
- Abstract: Representing and reasoning about 3D structures of macromolecules is emerging
as a distinct challenge in machine learning. Here, we extend recent work on
geometric vector perceptrons and apply equivariant graph neural networks to a
wide range of tasks from structural biology. Our method outperforms all
reference architectures on 4 out of 8 tasks in the ATOM3D benchmark and broadly
improves over rotation-invariant graph neural networks. We also demonstrate
that transfer learning can improve performance in learning from macromolecular
structure.
- Abstract(参考訳): マクロ分子の3d構造の表現と推論は、機械学習において明らかな課題として現れています。
本稿では,幾何ベクトルパーセプトロンに関する最近の研究を拡張し,構造生物学の幅広いタスクに等変グラフニューラルネットワークを適用する。
提案手法は,atom3dベンチマークで8タスク中4タスク中,すべての参照アーキテクチャを上回り,回転不変グラフニューラルネットワークを広範に改善する。
また,移動学習が高分子構造からの学習性能を向上させることを示す。
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