論文の概要: Equivariant Graph Attention Networks for Molecular Property Prediction

• arxiv url: http://arxiv.org/abs/2202.09891v1
• Date: Sun, 20 Feb 2022 19:07:29 GMT
• ステータス: 処理完了
• システム内更新日: 2022-02-25 09:53:37.519288
• Title: Equivariant Graph Attention Networks for Molecular Property Prediction
• Title（参考訳）: 分子特性予測のための同変グラフ注意ネットワーク
• Authors: Tuan Le, Frank No\'e, Djork-Arn\'e Clevert
• Abstract要約: 大きさの異なる3D分子構造について学ぶことは、機械学習、特に薬物発見における新たな課題である。 本稿では,カルテシアン座標を用いた等変グラフニューラルネットワーク(GNN)を提案する。 小分子の量子力学的性質の予測におけるアーキテクチャの有効性を実証し,タンパク質複合体などの高分子構造に関する問題に対するその利点を示す。
• 参考スコア（独自算出の注目度）: 0.34376560669160383
• License: http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
• Abstract: Learning and reasoning about 3D molecular structures with varying size is an emerging and important challenge in machine learning and especially in drug discovery. Equivariant Graph Neural Networks (GNNs) can simultaneously leverage the geometric and relational detail of the problem domain and are known to learn expressive representations through the propagation of information between nodes leveraging higher-order representations to faithfully express the geometry of the data, such as directionality in their intermediate layers. In this work, we propose an equivariant GNN that operates with Cartesian coordinates to incorporate directionality and we implement a novel attention mechanism, acting as a content and spatial dependent filter when propagating information between nodes. We demonstrate the efficacy of our architecture on predicting quantum mechanical properties of small molecules and its benefit on problems that concern macromolecular structures such as protein complexes.
• Abstract（参考訳）: 大きさの異なる3d分子構造の学習と推論は、機械学習、特に創薬において、新しくて重要な課題である。 等価グラフニューラルネットワーク(gnns)は問題領域の幾何学的および関係的詳細を同時に活用することができ、中間層における方向性のようなデータの幾何学を忠実に表現するために高階表現を利用するノード間の情報伝達を通じて表現的表現を学ぶことが知られている。 本研究では,デカルト座標と協調して方向性を持たせる同変gnnを提案し,ノード間の情報伝達において,コンテンツおよび空間依存フィルタとして機能する新しい注意機構を実装した。 小分子の量子力学的性質の予測におけるアーキテクチャの有効性と,タンパク質複合体などの高分子構造に関する問題に対する利点を示す。

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