論文の概要: Disentangling semantic features of macromolecules in Cryo-Electron Tomography

• arxiv url: http://arxiv.org/abs/2106.14192v1
• Date: Sun, 27 Jun 2021 10:41:26 GMT
• ステータス: 処理完了
• システム内更新日: 2021-06-29 17:52:40.554303
• Title: Disentangling semantic features of macromolecules in Cryo-Electron Tomography
• Title（参考訳）: Cryo-Electron Tomographyにおけるマクロ分子の遠方的意味的特徴
• Authors: Kai Yi, Jianye Pang, Yungeng Zhang, Xiangrui Zeng, Min Xu
• Abstract要約: マクロ分子のセマンティックな特徴を明示的に切り離すことは、マクロ分子の下流解析を行う上で重要である。 本稿では, 高分子の構造, 配向, シフトを明示的に切り離す3次元空間変動オートエンコーダを提案する。
• 参考スコア（独自算出の注目度）: 7.804210995893708
• License: http://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/4.0/
• Abstract: Cryo-electron tomography (Cryo-ET) is a 3D imaging technique that enables the systemic study of shape, abundance, and distribution of macromolecular structures in single cells in near-atomic resolution. However, the systematic and efficient $\textit{de novo}$ recognition and recovery of macromolecular structures captured by Cryo-ET are very challenging due to the structural complexity and imaging limits. Even macromolecules with identical structures have various appearances due to different orientations and imaging limits, such as noise and the missing wedge effect. Explicitly disentangling the semantic features of macromolecules is crucial for performing several downstream analyses on the macromolecules. This paper has addressed the problem by proposing a 3D Spatial Variational Autoencoder that explicitly disentangle the structure, orientation, and shift of macromolecules. Extensive experiments on both synthesized and real cryo-ET datasets and cross-domain evaluations demonstrate the efficacy of our method.
• Abstract（参考訳）: クライオ電子トモグラフィー(Cryo-Electronトモグラフィー、Cryo-ET)は、単細胞における分子構造の形状、存在量、分布の3次元イメージング技術である。 しかし、Cryo-ETによって捕獲されたマクロ分子構造の認識と回復は、構造的複雑さと画像的限界のために非常に困難である。 同じ構造を持つマクロ分子でさえ、異なる向きと画像の限界、例えばノイズや欠落したくさび効果によって様々な外観を持つ。 マクロ分子のセマンティックな特徴を明示的に切り離すことは、マクロ分子の下流解析を行う上で重要である。 本稿では, マクロ分子の構造, 配向, シフトを明示的に切り離す3次元空間変動オートエンコーダを提案することで, この問題に対処した。 合成および実際のcryo-etデータセットとクロスドメイン評価の両方に関する広範な実験により,本手法の有効性が示された。

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