論文の概要: EndoUDA: A modality independent segmentation approach for endoscopy
imaging
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2107.05342v1
- Date: Mon, 12 Jul 2021 11:57:33 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2021-07-13 20:05:59.050834
- Title: EndoUDA: A modality independent segmentation approach for endoscopy
imaging
- Title(参考訳): エンドウダ : 内視鏡イメージングのためのモダリティ独立セグメンテーションアプローチ
- Authors: Numan Celik, Sharib Ali, Soumya Gupta, Barbara Braden and Jens
Rittscher
- Abstract要約: 本稿では,変分オートエンコーダとU-Netを共通なEfficientNet-B4バックボーンに結合するUDAベースのセグメンテーション手法を提案する。
我々は,WLI(ソース)モードのみを用いてトレーニングした場合,NBI(ターゲット)モダリティを未確認のターゲットに一般化できることを示す。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 0.7874708385247353
- License: http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
- Abstract: Gastrointestinal (GI) cancer precursors require frequent monitoring for risk
stratification of patients. Automated segmentation methods can help to assess
risk areas more accurately, and assist in therapeutic procedures or even
removal. In clinical practice, addition to the conventional white-light imaging
(WLI), complimentary modalities such as narrow-band imaging (NBI) and
fluorescence imaging are used. While, today most segmentation approaches are
supervised and only concentrated on a single modality dataset, this work
exploits to use a target-independent unsupervised domain adaptation (UDA)
technique that is capable to generalize to an unseen target modality. In this
context, we propose a novel UDA-based segmentation method that couples the
variational autoencoder and U-Net with a common EfficientNet-B4 backbone, and
uses a joint loss for latent-space optimization for target samples. We show
that our model can generalize to unseen target NBI (target) modality when
trained using only WLI (source) modality. Our experiments on both upper and
lower GI endoscopy data show the effectiveness of our approach compared to
naive supervised approach and state-of-the-art UDA segmentation methods.
- Abstract(参考訳): 消化器癌の前駆体は、患者のリスク層化を頻繁に監視する必要がある。
自動セグメンテーション手法は、リスク領域をより正確に評価し、治療処置や除去を補助するのに役立つ。
臨床では、従来のホワイトライトイメージング(wli)に加えて、狭帯域イメージング(nbi)や蛍光イメージングなどの補完的モダリティが用いられる。
現在、ほとんどのセグメンテーションアプローチは単一のモダリティデータセットにのみ集中しているが、この研究は、対象に依存しない非教師なしドメイン適応(UDA)技術を利用して、目に見えないターゲットモダリティに一般化することができる。
そこで本研究では,可変オートエンコーダとu-netを共通省エネb4バックボーンに結合し,ターゲットサンプルの潜在空間最適化のための統合損失を用いる,新しいudaベースのセグメンテーション手法を提案する。
我々は,WLI(ソース)モードのみを用いてトレーニングした場合,NBI(ターゲット)モダリティを未確認対象に一般化できることを示す。
上部および下部のgi内視鏡データを用いた実験では,naive supervised approach と state-of-the-art uda segmentation 法との比較を行った。
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