論文の概要: Improving Early Sepsis Prediction with Multi Modal Learning
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2107.11094v1
- Date: Fri, 23 Jul 2021 09:25:31 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2021-07-26 19:32:56.478532
- Title: Improving Early Sepsis Prediction with Multi Modal Learning
- Title(参考訳): マルチモーダル学習による早期セプシス予測の改善
- Authors: Fred Qin, Vivek Madan, Ujjwal Ratan, Zohar Karnin, Vishaal Kapoor,
Parminder Bhatia, and Taha Kass-Hout
- Abstract要約: 臨床テキストは、敗血症の重症度を推定するために必要な情報を提供する。
Amazon Comprehend MedicalではBERTのような最先端のNLPモデルと高度に専門化されたNLPモデルを用いてテキストを表現している。
本手法は, セプシス予測のためのPhystoNet Computing in Cardiology Challengeの勝利モデルとともに, 専門医であるqSOFAが提案する臨床基準を著しく上回っている。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 5.129463113166068
- License: http://creativecommons.org/publicdomain/zero/1.0/
- Abstract: Sepsis is a life-threatening disease with high morbidity, mortality and
healthcare costs. The early prediction and administration of antibiotics and
intravenous fluids is considered crucial for the treatment of sepsis and can
save potentially millions of lives and billions in health care costs.
Professional clinical care practitioners have proposed clinical criterion which
aid in early detection of sepsis; however, performance of these criterion is
often limited. Clinical text provides essential information to estimate the
severity of the sepsis in addition to structured clinical data. In this study,
we explore how clinical text can complement structured data towards early
sepsis prediction task. In this paper, we propose multi modal model which
incorporates both structured data in the form of patient measurements as well
as textual notes on the patient. We employ state-of-the-art NLP models such as
BERT and a highly specialized NLP model in Amazon Comprehend Medical to
represent the text. On the MIMIC-III dataset containing records of ICU
admissions, we show that by using these notes, one achieves an improvement of
6.07 points in a standard utility score for Sepsis prediction and 2.89% in
AUROC score. Our methods significantly outperforms a clinical criteria
suggested by experts, qSOFA, as well as the winning model of the PhysioNet
Computing in Cardiology Challenge for predicting Sepsis.
- Abstract(参考訳): 敗血症は死亡率、死亡率、医療費が高い生命を脅かす病気である。
抗生物質と静脈内液の早期予測と管理は、敗血症の治療に不可欠であり、数百万人の命と数十億ドルの医療費を節約できると考えられている。
専門医は敗血症の早期発見を支援する臨床基準を提案したが、その性能は限られていることが多い。
臨床テキストは、構造的な臨床データに加えて、敗血症の重症度を推定するための必須情報を提供する。
本研究では, 臨床テキストが構造化データを早期敗血症予測タスクに補完する方法について検討する。
本稿では,患者測定の形式で構造化されたデータと,患者のテキストノートを組み込んだマルチモーダルモデルを提案する。
Amazon Comprehend MedicalではBERTのような最先端のNLPモデルと高度に専門化されたNLPモデルを用いてテキストを表現している。
ICU入院記録を含むMIMIC-IIIデータセットにおいて、これらのメモを用いて、Sepsis予測のための標準的なユーティリティスコアの6.07ポイント、AUROCスコアの2.89%の改善が達成されている。
本手法は, セプシス予測のためのPhystoNet Computing in Cardiology Challengeの勝利モデルとともに, 専門医であるqSOFAが提案する臨床基準を著しく上回っている。
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