論文の概要: FineEHR: Refine Clinical Note Representations to Improve Mortality
Prediction
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2304.11794v2
- Date: Thu, 4 May 2023 16:01:17 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2023-05-05 18:31:38.846977
- Title: FineEHR: Refine Clinical Note Representations to Improve Mortality
Prediction
- Title(参考訳): FineEHR: 死亡予測を改善するための臨床ノートのリファイン化
- Authors: Jun Wu, Xuesong Ye, Chengjie Mou and Weinan Dai
- Abstract要約: 大規模な電子健康記録は、臨床テキストとバイタルサインデータの豊富な機械学習モデルを提供する。
臨床ノート分析のための高度な自然言語処理(NLP)アルゴリズムの出現にもかかわらず、生臨床データに存在する複雑なテキスト構造とノイズは重大な課題となっている。
本稿では,2つの表現学習技術,すなわちメートル法学習と微調整技術を用いて,臨床ノートの埋め込みを洗練させるシステムFINEEHRを提案する。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 3.9026461169566673
- License: http://arxiv.org/licenses/nonexclusive-distrib/1.0/
- Abstract: Monitoring the health status of patients in the Intensive Care Unit (ICU) is
a critical aspect of providing superior care and treatment. The availability of
large-scale electronic health records (EHR) provides machine learning models
with an abundance of clinical text and vital sign data, enabling them to make
highly accurate predictions. Despite the emergence of advanced Natural Language
Processing (NLP) algorithms for clinical note analysis, the complex textual
structure and noise present in raw clinical data have posed significant
challenges. Coarse embedding approaches without domain-specific refinement have
limited the accuracy of these algorithms. To address this issue, we propose
FINEEHR, a system that utilizes two representation learning techniques, namely
metric learning and fine-tuning, to refine clinical note embeddings, while
leveraging the intrinsic correlations among different health statuses and note
categories. We evaluate the performance of FINEEHR using two metrics, namely
Area Under the Curve (AUC) and AUC-PR, on a real-world MIMIC III dataset. Our
experimental results demonstrate that both refinement approaches improve
prediction accuracy, and their combination yields the best results. Moreover,
our proposed method outperforms prior works, with an AUC improvement of over
10%, achieving an average AUC of 96.04% and an average AUC-PR of 96.48% across
various classifiers.
- Abstract(参考訳): 集中治療室(ICU)患者の健康状態のモニタリングは、優れたケアと治療を提供する上で重要な側面である。
大規模電子健康記録(ehr)の可用性は、臨床テキストとバイタルサインデータを豊富に含む機械学習モデルを提供し、高精度な予測を可能にする。
臨床ノート分析のための高度な自然言語処理(NLP)アルゴリズムの出現にもかかわらず、生臨床データに存在する複雑なテキスト構造とノイズは重大な課題となっている。
ドメイン固有の洗練のない粗い埋め込みアプローチは、これらのアルゴリズムの精度を制限している。
そこで本研究では,2つの表現学習技術,すなわちメートル法学習と微調整を併用したFINEEHRを用いて,異なる健康状態とノートカテゴリーの内在的相関を生かしながら,臨床ノートの埋め込みを洗練させるシステムを提案する。
実世界のMIMIC IIIデータセットを用いて,AUC(Area Under the Curve)とAUC-PRの2つの指標を用いてFINEEHRの性能を評価する。
実験結果から,両改良法が予測精度を向上し,それらの組み合わせが最良の結果をもたらすことが示された。
さらに, 提案手法は, aucが10%以上向上し, 平均 auc が96.04%, auc-pr が96.48%, auc-pr が96.48%となった。
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