論文の概要: Technical Report: Quality Assessment Tool for Machine Learning with
Clinical CT
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2107.12842v1
- Date: Tue, 27 Jul 2021 14:19:08 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2021-07-28 14:38:32.157773
- Title: Technical Report: Quality Assessment Tool for Machine Learning with
Clinical CT
- Title(参考訳): 臨床ctを用いた機械学習の品質評価ツール
- Authors: Riqiang Gao, Mirza S. Khan, Yucheng Tang, Kaiwen Xu, Steve Deppen,
Yuankai Huo, Kim L. Sandler, Pierre P. Massion, Bennett A. Landman
- Abstract要約: 画像品質評価(IQA)は科学的調査、特に医用画像や機械学習において重要である。
実際には、ネットワーク問題、高速化された取得、モーションアーティファクト、イメージングプロトコル設計などの複数の要因が、画像収集の解釈を妨げる可能性がある。
そこで我々は,臨床的に得られたCTデータの大規模データマイニングで発生する問題を特定し,解決するためのパイプラインを作成した。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 3.8144111843457327
- License: http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/
- Abstract: Image Quality Assessment (IQA) is important for scientific inquiry,
especially in medical imaging and machine learning. Potential data quality
issues can be exacerbated when human-based workflows use limited views of the
data that may obscure digital artifacts. In practice, multiple factors such as
network issues, accelerated acquisitions, motion artifacts, and imaging
protocol design can impede the interpretation of image collections. The medical
image processing community has developed a wide variety of tools for the
inspection and validation of imaging data. Yet, IQA of computed tomography (CT)
remains an under-recognized challenge, and no user-friendly tool is commonly
available to address these potential issues. Here, we create and illustrate a
pipeline specifically designed to identify and resolve issues encountered with
large-scale data mining of clinically acquired CT data. Using the widely
studied National Lung Screening Trial (NLST), we have identified approximately
4% of image volumes with quality concerns out of 17,392 scans. To assess
robustness, we applied the proposed pipeline to our internal datasets where we
find our tool is generalizable to clinically acquired medical images. In
conclusion, the tool has been useful and time-saving for research study of
clinical data, and the code and tutorials are publicly available at
https://github.com/MASILab/QA_tool.
- Abstract(参考訳): 画像品質評価(IQA)は科学的調査、特に医用画像や機械学習において重要である。
人間のワークフローがデジタルアーティファクトを隠蔽する可能性のあるデータの限られたビューを使用する場合、潜在的なデータ品質の問題が悪化する可能性がある。
実際には、ネットワーク問題、高速化された取得、モーションアーティファクト、イメージングプロトコル設計などの複数の要因が、画像収集の解釈を妨げる可能性がある。
医用画像処理コミュニティは、画像データの検査と検証のための多種多様なツールを開発した。
しかし、CT(Computerd tomography)のIQAは未認識の課題であり、これらの潜在的な問題に対処するためのユーザフレンドリなツールが一般には使用されていない。
そこで我々は,臨床的に得られたCTデータの大規模データマイニングで発生する問題を特定し,解決するためのパイプラインを作成した。
全国肺スクリーニング試験 (nlst) により, 17,392回のスキャンのうち, 画像量の約4%が品質に懸念があることが明らかとなった。
堅牢性を評価するために,提案するパイプラインを内部データセットに適用し,臨床で取得した医用画像に汎用性があることを確認した。
結論として、このツールは臨床データの研究に役立ち、時間節約に役立ち、コードとチュートリアルはhttps://github.com/masilab/qa_toolで公開されている。
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