論文の概要: Diachronic Text Mining Investigation of Therapeutic Candidates for
COVID-19
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2110.13971v1
- Date: Tue, 26 Oct 2021 19:20:26 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2021-10-31 11:49:03.244283
- Title: Diachronic Text Mining Investigation of Therapeutic Candidates for
COVID-19
- Title(参考訳): ダイアクロニックテキストマイニングによるcovid-19治療候補の検討
- Authors: James Powell, Kari Sentz
- Abstract要約: 我々は、短時間のダイアクロニックテキストマイニングを用いて、コクレンスを同定し、潜在的な候補治療の挙動を分析する。
その結果,CORD-19コーパスの時間的事例では,少なくとも25%が検出された。
検出したパターンは,ダイアクロニックテキストマイニングによる薬物再資源化活動の追跡に有用であることを示す。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 0.0
- License: http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
- Abstract: Diachronic text mining has frequently been applied to long-term linguistic
surveys of word meaning and usage shifts over time. In this paper we apply
short-term diachronic text mining to a rapidly growing corpus of scientific
publications on COVID-19 captured in the CORD-19 dataset in order to identify
co-occurrences and analyze the behavior of potential candidate treatments. We
used a data set associated with a COVID-19 drug re-purposing study from Oak
Ridge National Laboratory. This study identified existing candidate coronavirus
treatments, including drugs and approved compounds, which had been analyzed and
ranked according to their potential for blocking the ability of the SARS-COV-2
virus to invade human cells. We investigated the occurrence of these candidates
in temporal instances of the CORD-19 corpus. We found that at least 25% of the
identified terms occurred in temporal instances of the corpus to the extent
that their frequency and contextual dynamics could be evaluated. We identified
three classes of behaviors: those where frequency and contextual shifts were
small and positively correlated; those where there was no correlation between
frequency and contextual changes; and those where there was a negative
correlation between frequency and contextual shift. We speculate that the
latter two patterns are indicative that a target candidate therapeutics is
undergoing active evaluation. The patterns we detected demonstrate the
potential benefits of using diachronic text mining techniques with a large
dynamic text corpus to track drug-repurposing activities across international
clinical and laboratory settings.
- Abstract(参考訳): ダイアクロニックテキストマイニングは、単語の意味と使用法の変化の長期にわたる言語調査にしばしば適用されてきた。
本稿では,CORD-19データセットに記録された新型コロナウイルスに関する研究論文のコーパスに,短時間のダイアクロニックテキストマイニングを適用し,コクレンスを同定し,潜在的治療の行動を解析する。
オークリッジ国立研究所(Oak Ridge National Laboratory)のCOVID-19薬物再購入研究に関連するデータセットを使用した。
この研究では、SARS-COV-2ウイルスがヒト細胞に侵入する能力を阻害する可能性に基づいて分析され、ランキングされた薬物や承認された化合物を含む、既存の新型コロナウイルス治療候補を特定した。
CORD-19コーパスの時間的事例におけるこれらの候補の発生について検討した。
検出された用語の少なくとも25%がコーパスの時間的インスタンスで発生し、その頻度と文脈的ダイナミクスが評価可能であることが判明した。
行動は,頻度と文脈の変化が小さく正の相関関係にあるもの,頻度と文脈の変化の間に相関がないもの,頻度と文脈の変化の間に負の相関があるもの,の3種類を同定した。
後者の2つのパターンは、ターゲット候補治療が積極的な評価を受けていることを示すものであると推測する。
ダイアクロニックテキストマイニング技術と大規模ダイナミックテキストコーパスを併用し,国際臨床・実験室における薬物再資源化活動の追跡に有用である可能性が示唆された。
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