論文の概要: Partial supervision for the FeTA challenge 2021
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2111.02408v1
- Date: Wed, 3 Nov 2021 16:48:39 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2021-11-05 12:13:25.498753
- Title: Partial supervision for the FeTA challenge 2021
- Title(参考訳): FeTAチャレンジ2021における部分的監督
- Authors: Lucas Fidon, Michael Aertsen, Suprosanna Shit, Philippe Demaerel,
S\'ebastien Ourselin, Jan Deprest and Tom Vercauteren
- Abstract要約: 医用画像分割のための畳み込みニューラルネットワークの性能は、トレーニングデータの数と正の相関関係があると考えられている。
FeTAチャレンジは、提供されたトレーニングデータのみの使用を参加者に制限するのではなく、他の公開ソースの使用も許可している。
本稿では,最新のディープラーニングパイプラインのセグメンテーション性能を向上させるためにラベルセット損失関数を提案する。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 5.388159776780446
- License: http://arxiv.org/licenses/nonexclusive-distrib/1.0/
- Abstract: This paper describes our method for our participation in the FeTA
challenge2021 (team name: TRABIT). The performance of convolutional neural
networks for medical image segmentation is thought to correlate positively with
the number of training data. The FeTA challenge does not restrict participants
to using only the provided training data but also allows for using other
publicly available sources. Yet, open access fetal brain data remains limited.
An advantageous strategy could thus be to expand the training data to cover
broader perinatal brain imaging sources. Perinatal brain MRIs, other than the
FeTA challenge data, that are currently publicly available, span normal and
pathological fetal atlases as well as neonatal scans. However, perinatal brain
MRIs segmented in different datasets typically come with different annotation
protocols. This makes it challenging to combine those datasets to train a deep
neural network. We recently proposed a family of loss functions, the label-set
loss functions, for partially supervised learning. Label-set loss functions
allow to train deep neural networks with partially segmented images, i.e.
segmentations in which some classes may be grouped into super-classes. We
propose to use label-set loss functions to improve the segmentation performance
of a state-of-the-art deep learning pipeline for multi-class fetal brain
segmentation by merging several publicly available datasets. To promote
generalisability, our approach does not introduce any additional
hyper-parameters tuning.
- Abstract(参考訳): 本稿では, FeTA Challenge2021(チーム名TRABIT)への参加について述べる。
医用画像分割のための畳み込みニューラルネットワークの性能は,トレーニングデータ数と正の相関があると考えられる。
FeTAチャレンジは、提供されたトレーニングデータのみの使用を制限するだけでなく、他の公開ソースの使用も許可している。
しかし、オープンアクセス胎児の脳データはまだ限られている。
したがって、より広い周産期脳画像源をカバーするためにトレーニングデータを拡張するという利点がある。
FeTAチャレンジデータ以外の周産期脳MRIは、現在公開されており、正常および病理学的胎児のアトラスと新生児スキャンにまたがっている。
しかし、異なるデータセットに区切られた周産期脳MRIは通常、異なるアノテーションプロトコルを持つ。
これにより、これらのデータセットを組み合わせることで、ディープニューラルネットワークのトレーニングが困難になる。
我々は最近,部分教師付き学習のためのラベルセット損失関数という損失関数の族を提案した。
ラベルセット損失関数は、部分分割された画像、すなわちいくつかのクラスをスーパークラスに分類できるセグメンテーションでディープニューラルネットワークを訓練することができる。
本稿では,複数の公開データセットをマージすることで,マルチクラスの胎児脳セグメンテーションのための最先端ディープラーニングパイプラインのセグメンテーション性能を向上させるためにラベルセット損失関数を提案する。
一般化性を促進するため,提案手法は追加のハイパーパラメータチューニングを導入しない。
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