論文の概要: Predicting Infant Brain Connectivity with Federated Multi-Trajectory
GNNs using Scarce Data
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2401.01383v2
- Date: Mon, 8 Jan 2024 09:46:38 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2024-01-09 21:24:35.124182
- Title: Predicting Infant Brain Connectivity with Federated Multi-Trajectory
GNNs using Scarce Data
- Title(参考訳): スカースデータを用いた多軌道GNNによる乳幼児脳結合性の予測
- Authors: Michalis Pistos, Gang Li, Weili Lin, Dinggang Shen and Islem Rekik
- Abstract要約: 既存のディープラーニングソリューションには,3つの大きな制限がある。
我々はフェデレートグラフベースの多軌道進化ネットワークであるFedGmTE-Net++を紹介する。
フェデレーションの力を利用して、限られたデータセットを持つ多種多様な病院の地域学習を集約する。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 54.55126643084341
- License: http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/
- Abstract: The understanding of the convoluted evolution of infant brain networks during
the first postnatal year is pivotal for identifying the dynamics of early brain
connectivity development. Existing deep learning solutions suffer from three
major limitations. First, they cannot generalize to multi-trajectory prediction
tasks, where each graph trajectory corresponds to a particular imaging modality
or connectivity type (e.g., T1-w MRI). Second, existing models require
extensive training datasets to achieve satisfactory performance which are often
challenging to obtain. Third, they do not efficiently utilize incomplete time
series data. To address these limitations, we introduce FedGmTE-Net++, a
federated graph-based multi-trajectory evolution network. Using the power of
federation, we aggregate local learnings among diverse hospitals with limited
datasets. As a result, we enhance the performance of each hospital's local
generative model, while preserving data privacy. The three key innovations of
FedGmTE-Net++ are: (i) presenting the first federated learning framework
specifically designed for brain multi-trajectory evolution prediction in a
data-scarce environment, (ii) incorporating an auxiliary regularizer in the
local objective function to exploit all the longitudinal brain connectivity
within the evolution trajectory and maximize data utilization, (iii)
introducing a two-step imputation process, comprising a preliminary KNN-based
precompletion followed by an imputation refinement step that employs regressors
to improve similarity scores and refine imputations. Our comprehensive
experimental results showed the outperformance of FedGmTE-Net++ in brain
multi-trajectory prediction from a single baseline graph in comparison with
benchmark methods.
- Abstract(参考訳): 産後1年間における幼児脳ネットワークの畳み込み進化の理解は、初期の脳接続発達のダイナミクスを特定する上で重要である。
既存のディープラーニングソリューションには3つの大きな制限がある。
まず、各グラフ軌跡が特定の画像モダリティや接続タイプ(例えばT1-w MRI)に対応するようなマルチトラック予測タスクには一般化できない。
第二に、既存のモデルは十分なパフォーマンスを達成するために広範なトレーニングデータセットが必要です。
第3に、不完全な時系列データを効率的に利用しない。
これらの制約に対処するために、フェデレーショングラフベースの多軌道進化ネットワークであるFedGmTE-Net++を導入する。
フェデレーションの力を利用して、限られたデータセットを持つ多様な病院の地域学習を集約する。
その結果,データプライバシを保ちながら,各病院の局所的生成モデルの性能を向上させることができた。
FedGmTE-Net++の3つの重要なイノベーションは次のとおりである。
(i)データキャリア環境における脳のマルチトラック進化予測専用に設計された最初の連合学習フレームワークの提示
(ii)局所目的関数に補助正則化器を組み込んで、進化軌道内の全ての縦脳接続を活用し、データ利用を最大化すること。
(iii)予備的なknベースのプリコンプリートと、類似度スコアを改善し、インプチューションを洗練するためにレグレッサーを用いるインプテーション改良ステップとからなる2段階インプテーションプロセスを導入すること。
総合的な実験結果から,単一のベースライングラフからの脳内多軌道予測におけるFedGmTE-Net++の性能がベンチマーク法と比較された。
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