論文の概要: Advancing Brain Metastases Detection in T1-Weighted Contrast-Enhanced 3D
MRI using Noisy Student-based Training
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2111.05959v1
- Date: Wed, 10 Nov 2021 21:44:57 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2021-11-12 15:03:38.639182
- Title: Advancing Brain Metastases Detection in T1-Weighted Contrast-Enhanced 3D
MRI using Noisy Student-based Training
- Title(参考訳): 雑音学習を用いたT1強調造影MRIにおける脳転移の検出
- Authors: Engin Dikici, Xuan V. Nguyen, Matthew Bigelow, John. L. Ryu, and
Luciano M. Prevedello
- Abstract要約: 本研究は, 未ラベルのT1cデータの大規模コーパスを活用するため, ノイズの多い学生による自己学習戦略により, フレームワークを前進させることを目的としている。
ラベル付き217とラベルなし1247のT1c試験を2倍のクロスバリデーションで行った。
ラベル付き試験のみを使用したフレームワークは、90%のBM検出感度で9.23の偽陽性を発生させ、一方、導入した学習戦略を使用したフレームワークは、9%の誤検出を減少させた。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 1.101002667958165
- License: http://arxiv.org/licenses/nonexclusive-distrib/1.0/
- Abstract: The detection of brain metastases (BM) in their early stages could have a
positive impact on the outcome of cancer patients. We previously developed a
framework for detecting small BM (with diameters of less than 15mm) in
T1-weighted Contrast-Enhanced 3D Magnetic Resonance images (T1c) to assist
medical experts in this time-sensitive and high-stakes task. The framework
utilizes a dedicated convolutional neural network (CNN) trained using labeled
T1c data, where the ground truth BM segmentations were provided by a
radiologist. This study aims to advance the framework with a noisy
student-based self-training strategy to make use of a large corpus of unlabeled
T1c data (i.e., data without BM segmentations or detections). Accordingly, the
work (1) describes the student and teacher CNN architectures, (2) presents data
and model noising mechanisms, and (3) introduces a novel pseudo-labeling
strategy factoring in the learned BM detection sensitivity of the framework.
Finally, it describes a semi-supervised learning strategy utilizing these
components. We performed the validation using 217 labeled and 1247 unlabeled
T1c exams via 2-fold cross-validation. The framework utilizing only the labeled
exams produced 9.23 false positives for 90% BM detection sensitivity; whereas,
the framework using the introduced learning strategy led to ~9% reduction in
false detections (i.e., 8.44) for the same sensitivity level. Furthermore,
while experiments utilizing 75% and 50% of the labeled datasets resulted in
algorithm performance degradation (12.19 and 13.89 false positives
respectively), the impact was less pronounced with the noisy student-based
training strategy (10.79 and 12.37 false positives respectively).
- Abstract(参考訳): 脳転移(BM)の早期発見は、がん患者の予後に肯定的な影響を及ぼす可能性がある。
本研究では,T1強調コントラスト強調3次元磁気共鳴画像(T1c)における小型BM(直径15mm未満)検出のためのフレームワークを開発した。
このフレームワークは、ラベル付きt1cデータを使用してトレーニングされた専用の畳み込みニューラルネットワーク(cnn)を使用しており、基底真理bmセグメンテーションは放射線学者によって提供された。
本研究の目的は,無ラベルのT1cデータ(BMセグメンテーションや検出のないデータ)の大量コーパスを利用するため,ノイズの多い学生による自己学習戦略でフレームワークを前進させることである。
その結果,(1)学生と教師のCNNアーキテクチャを記述し,(2)データとモデルノーミング機構を提示し,(3)学習したBM検出感度に影響を及ぼす新しい擬似ラベル戦略を導入する。
最後に,これらを利用した半教師付き学習戦略について述べる。
ラベル付き217とラベルなし1247のT1c試験を2倍のクロスバリデーションで行った。
ラベル付き試験のみを用いたフレームワークでは、90%のbm検出感度で9.23の偽陽性が得られたが、導入された学習戦略を用いたフレームワークでは、同じ感度で9%の偽検出率(すなわち8.44)が低下した。
さらに、ラベル付きデータセットの75%と50%を用いた実験はアルゴリズムの性能劣化(それぞれ12.19と13.89の偽陽性)をもたらしたが、ノイズの多い学生ベースのトレーニング戦略(それぞれ10.79と12.37の偽陽性)では影響は低かった。
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