論文の概要: Genetic Algorithm for Constrained Molecular Inverse Design
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2112.03518v1
- Date: Tue, 7 Dec 2021 05:58:44 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2021-12-09 00:35:47.779648
- Title: Genetic Algorithm for Constrained Molecular Inverse Design
- Title(参考訳): 制約分子逆設計のための遺伝的アルゴリズム
- Authors: Yurim Lee, Gydam Choi, Minsug Yoon, and Cheongwon Kim
- Abstract要約: 制約付き分子逆設計を特徴とする遺伝的アルゴリズムを提案する。
提案アルゴリズムはクロスオーバーと突然変異に有効な分子を生成する。
実験により,本アルゴリズムは構造的制約を保ちながら,特定の性質を満たす分子を効果的に発見できることが証明された。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 0.1086166673827221
- License: http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
- Abstract: A genetic algorithm is suitable for exploring large search spaces as it finds
an approximate solution. Because of this advantage, genetic algorithm is
effective in exploring vast and unknown space such as molecular search space.
Though the algorithm is suitable for searching vast chemical space, it is
difficult to optimize pharmacological properties while maintaining molecular
substructure. To solve this issue, we introduce a genetic algorithm featuring a
constrained molecular inverse design. The proposed algorithm successfully
produces valid molecules for crossover and mutation. Furthermore, it optimizes
specific properties while adhering to structural constraints using a two-phase
optimization. Experiments prove that our algorithm effectively finds molecules
that satisfy specific properties while maintaining structural constraints.
- Abstract(参考訳): 遺伝的アルゴリズムは、近似解を見つけるときに大きな探索空間を探すのに適している。
この利点により、遺伝的アルゴリズムは分子探索空間のような広範囲で未知の空間を探索するのに有効である。
このアルゴリズムは広大な化学空間の探索に適しているが、分子構造を維持しながら薬理学的性質を最適化することは困難である。
本稿では,制約のある分子逆設計を特徴とする遺伝的アルゴリズムを提案する。
提案アルゴリズムはクロスオーバーと突然変異に有効な分子を生成する。
さらに、2相最適化を用いて構造制約に固執しながら、特定の特性を最適化する。
実験により,本アルゴリズムは構造的制約を維持しつつ,特定の性質を満たす分子を効果的に発見できることを示した。
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