論文の概要: Quantum Algorithm for the Shortest Superstring Problem
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2112.13319v1
- Date: Sun, 26 Dec 2021 05:37:56 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2021-12-28 16:47:49.204472
- Title: Quantum Algorithm for the Shortest Superstring Problem
- Title(参考訳): 最短超弦問題に対する量子アルゴリズム
- Authors: Kamil Khadiev and Carlos Manuel Bosch Machado
- Abstract要約: 我々は、最短スーパーストリング問題(SSP)または最短共通スーパーストリング問題(SCS)を考える。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 0.0
- License: http://arxiv.org/licenses/nonexclusive-distrib/1.0/
- Abstract: In this paper, we consider the ``Shortest Superstring Problem''(SSP) or the
``Shortest Common Superstring Problem''(SCS). The problem is as follows. For a
positive integer $n$, a sequence of n strings $S=(s^1,\dots,s^n)$ is given. We
should construct the shortest string $t$ (we call it superstring) that contains
each string from the given sequence as a substring. The problem is connected
with the sequence assembly method for reconstructing a long DNA sequence from
small fragments. We present a quantum algorithm with running time
$O^*(1.728^n)$. Here $O^*$ notation does not consider polynomials of $n$ and
the length of $t$.
- Abstract(参考訳): 本稿では,「Shortest Superstring Problem」 (SSP) や「Shortest Common Superstring Problem」 (SCS) を考える。
問題は次の通りである。
正の整数 $n$ に対して、n 個の文字列の列 $S=(s^1,\dots,s^n)$ が与えられる。
与えられたシーケンスの各文字列をサブ文字列として含む最も短い文字列$t$(superstringと呼ぶ)を構築するべきです。
この問題は、小さな断片から長いDNA配列を再構成する配列組立法と関係している。
実行時間$O^*(1.728^n)$とする量子アルゴリズムを提案する。
ここで、$O^*$表記は$n$の多項式と$t$の長さを考慮しない。
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