論文の概要: Quantum Algorithms for the Shortest Common Superstring and Text
Assembling Problems
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2306.10572v2
- Date: Sun, 31 Dec 2023 18:12:03 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2024-01-03 20:00:05.440995
- Title: Quantum Algorithms for the Shortest Common Superstring and Text
Assembling Problems
- Title(参考訳): 最短共通スーパーストリングとテキスト集合問題に対する量子アルゴリズム
- Authors: Kamil Khadiev, Carlos Manuel Bosch Machado, Zeyu Chen, Junde Wu
- Abstract要約: テキスト集合問題の2つのバージョンについて考察する。
文字列のシーケンスは$s1,dots,sn$ of total length $L$ that is a dictionary, string $t$ of length $m$ that is textsです。
どちらの問題に対しても、従来の量子アルゴリズムよりもうまく動作する新しい量子アルゴリズムを提案する。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 11.048346250166073
- License: http://arxiv.org/licenses/nonexclusive-distrib/1.0/
- Abstract: In this paper, we consider two versions of the Text Assembling problem. We
are given a sequence of strings $s^1,\dots,s^n$ of total length $L$ that is a
dictionary, and a string $t$ of length $m$ that is texts. The first version of
the problem is assembling $t$ from the dictionary. The second version is the
``Shortest Superstring Problem''(SSP) or the ``Shortest Common Superstring
Problem''(SCS). In this case, $t$ is not given, and we should construct the
shortest string (we call it superstring) that contains each string from the
given sequence as a substring. These problems are connected with the sequence
assembly method for reconstructing a long DNA sequence from small fragments.
For both problems, we suggest new quantum algorithms that work better than
their classical counterparts. In the first case, we present a quantum algorithm
with $O(m+\log m\sqrt{nL})$ running time. In the case of SSP, we present a
quantum algorithm with running time $O(n^3 1.728^n +L
+\sqrt{L}n^{1.5}+\sqrt{L}n\log^2L\log^2n)$.
- Abstract(参考訳): 本稿では,テキスト集合問題の2つのバージョンについて考察する。
文字列の列$s^1,\dots,s^n$ of total length $l$(辞書)と$t$ of length $m$(テキスト)が与えられます。
問題の最初のバージョンは、辞書から$t$を組み立てることである。
2番目のバージョンは ``Shortest Superstring Problem' (SSP) または ``Shortest Common Superstring Problem' (SCS) である。
この場合、$t$は与えられず、与えられたシーケンスから各文字列をサブストリングとして含む最短文字列(スーパーストリングと呼ぶ)を構築するべきです。
これらの問題は、小さな断片から長いDNA配列を再構成する配列アセンブリー法に関連付けられている。
どちらの問題に対しても、従来のアルゴリズムよりも優れた量子アルゴリズムを提案する。
最初のケースでは、$O(m+\log m\sqrt{nL})$ run time の量子アルゴリズムを示す。
SSP の場合、実行時間 $O(n^3 1.728^n +L +\sqrt{L}n^{1.5}+\sqrt{L}n\log^2L\log^2n)$ の量子アルゴリズムを示す。
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