論文の概要: MSHT: Multi-stage Hybrid Transformer for the ROSE Image Analysis of
Pancreatic Cancer
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2112.13513v1
- Date: Mon, 27 Dec 2021 05:04:11 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2021-12-28 16:12:21.033885
- Title: MSHT: Multi-stage Hybrid Transformer for the ROSE Image Analysis of
Pancreatic Cancer
- Title(参考訳): MSHT : 膵癌のROSE画像解析のための多段階ハイブリッドトランス
- Authors: Tianyi Zhang, Yunlu Feng, Yu Zhao, Guangda Fan, Aiming Yang, Shangqin
Lyu, Peng Zhang, Fan Song, Chenbin Ma, Yangyang Sun, Youdan Feng, and
Guanglei Zhang
- Abstract要約: 膵癌は世界で最も悪性ながんの1つであり、非常に高い死亡率で急速に悪化する。
自動ワークフローを実現するために,ハイブリッドな高性能ディープラーニングモデルを提案する。
4240個のROSE画像のデータセットを収集し、この未探索領域における手法を評価する。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 5.604939010661757
- License: http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/
- Abstract: Pancreatic cancer is one of the most malignant cancers in the world, which
deteriorates rapidly with very high mortality. The rapid on-site evaluation
(ROSE) technique innovates the workflow by immediately analyzing the fast
stained cytopathological images with on-site pathologists, which enables faster
diagnosis in this time-pressured process. However, the wider expansion of ROSE
diagnosis has been hindered by the lack of experienced pathologists. To
overcome this problem, we propose a hybrid high-performance deep learning model
to enable the automated workflow, thus freeing the occupation of the valuable
time of pathologists. By firstly introducing the Transformer block into this
field with our particular multi-stage hybrid design, the spatial features
generated by the convolutional neural network (CNN) significantly enhance the
Transformer global modeling. Turning multi-stage spatial features as global
attention guidance, this design combines the robustness from the inductive bias
of CNN with the sophisticated global modeling power of Transformer. A dataset
of 4240 ROSE images is collected to evaluate the method in this unexplored
field. The proposed multi-stage hybrid Transformer (MSHT) achieves 95.68% in
classification accuracy, which is distinctively higher than the
state-of-the-art models. Facing the need for interpretability, MSHT outperforms
its counterparts with more accurate attention regions. The results demonstrate
that the MSHT can distinguish cancer samples accurately at an unprecedented
image scale, laying the foundation for deploying automatic decision systems and
enabling the expansion of ROSE in clinical practice. The code and records are
available at: https://github.com/sagizty/Multi-Stage-Hybrid-Transformer.
- Abstract(参考訳): 膵癌は世界で最も悪性ながんの1つであり、非常に高い死亡率で急速に悪化する。
迅速オンサイト評価 (ROSE) 技術は, 早期の染色細胞病理像を現場病理医に即時解析することで, そのワークフローを革新し, 時間的圧迫による診断を高速化する。
しかし、ROSEの診断範囲の拡大は、経験豊富な病理医の欠如によって妨げられている。
この問題を解決するために、我々は、自動化ワークフローを実現するためのハイブリッドな高性能ディープラーニングモデルを提案する。
まず,多段ハイブリッド設計によるトランスフォーマーブロックの導入により,畳み込みニューラルネットワーク(cnn)が生成する空間的特徴により,トランスフォーマーグローバルモデリングが大幅に向上した。
この設計は、cnnの帰納的バイアスとトランスフォーマの洗練されたグローバルモデリング能力との強固さを組み合わせたものである。
4240個のROSE画像のデータセットを収集し、この未探索領域における手法を評価する。
提案する多段ハイブリッド変圧器 (msht) は分類精度95.68%を達成し, 最新モデルよりも顕著に高い。
解釈可能性の必要性に直面したMSHTは、より正確な注意領域を持つ相手よりも優れている。
以上の結果から,MSHTは前例のない画像スケールでがん検体を正確に識別し,自動判定システムの構築と臨床実践におけるROSEの拡張を可能にする基盤を築き上げた。
コードとレコードは、https://github.com/sagizty/Multi-Stage-Hybrid-Transformerで入手できる。
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