論文の概要: Point-Unet: A Context-aware Point-based Neural Network for Volumetric
Segmentation
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2203.08964v1
- Date: Wed, 16 Mar 2022 22:02:08 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2022-03-18 14:42:27.932090
- Title: Point-Unet: A Context-aware Point-based Neural Network for Volumetric
Segmentation
- Title(参考訳): Point-Unet: ボリュームセグメンテーションのためのコンテキスト認識型ポイントベースニューラルネットワーク
- Authors: Ngoc-Vuong Ho, Tan Nguyen, Gia-Han Diep, Ngan Le, Binh-Son Hua
- Abstract要約: 本稿では,3次元点雲による深層学習の効率をボリュームセグメンテーションに組み込む新しい手法であるPoint-Unetを提案する。
私たちのキーとなるアイデアは、まず注意確率マップを学習することで、ボリュームに対する関心領域を予測することです。
異なるメトリクスに関する包括的なベンチマークでは、私たちのコンテキスト認識のPoint-UnetがSOTAのボクセルベースネットワークより優れていることが示されている。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 9.369208596745937
- License: http://arxiv.org/licenses/nonexclusive-distrib/1.0/
- Abstract: Medical image analysis using deep learning has recently been prevalent,
showing great performance for various downstream tasks including medical image
segmentation and its sibling, volumetric image segmentation. Particularly, a
typical volumetric segmentation network strongly relies on a voxel grid
representation which treats volumetric data as a stack of individual voxel
`slices', which allows learning to segment a voxel grid to be as
straightforward as extending existing image-based segmentation networks to the
3D domain. However, using a voxel grid representation requires a large memory
footprint, expensive test-time and limiting the scalability of the solutions.
In this paper, we propose Point-Unet, a novel method that incorporates the
efficiency of deep learning with 3D point clouds into volumetric segmentation.
Our key idea is to first predict the regions of interest in the volume by
learning an attentional probability map, which is then used for sampling the
volume into a sparse point cloud that is subsequently segmented using a
point-based neural network. We have conducted the experiments on the medical
volumetric segmentation task with both a small-scale dataset Pancreas and
large-scale datasets BraTS18, BraTS19, and BraTS20 challenges. A comprehensive
benchmark on different metrics has shown that our context-aware Point-Unet
robustly outperforms the SOTA voxel-based networks at both accuracies, memory
usage during training, and time consumption during testing. Our code is
available at https://github.com/VinAIResearch/Point-Unet.
- Abstract(参考訳): 近年, 深層学習を用いた医用画像解析が盛んに行われており, 医用画像セグメンテーションや兄弟姉妹, ボリューム画像セグメンテーションなど, 下流業務に優れた性能を発揮している。
特に、典型的なボリュームセグメンテーションネットワークは、ボリュームデータを個々のvoxel ‘slices’のスタックとして扱うvoxelグリッド表現に強く依存しており、学習者はvoxelグリッドを既存のイメージベースのセグメンテーションネットワークを3dドメインに拡張するのと同じくらい簡単にセグメンテーションすることができる。
しかしながら、voxelグリッド表現を使用するには、大きなメモリフットプリント、高価なテスト時間、ソリューションのスケーラビリティの制限が必要になる。
本稿では,3次元点雲を用いた深層学習の効率を体積区分に組み込んだ新しい手法であるpoint-unetを提案する。
私たちのキーとなるアイデアは、まず注意確率マップを学習してボリュームの関心領域を予測し、その後、ポイントベースニューラルネットワークを用いて分割されたスパーポイントクラウドにボリュームをサンプリングすることです。
brats18,brats19,brats20といった小規模データセットと大規模データセットの両方を用いて,医療容積分割タスクの実験を行った。
異なるメトリクスに関する包括的なベンチマークによると、私たちのコンテキスト認識のPoint-Unetは、SOTAのボクセルベースのネットワークを、トレーニング中のメモリ使用量、テスト中の時間消費の両方で、しっかりと性能を上げている。
私たちのコードはhttps://github.com/vinairesearch/point-unetで利用可能です。
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