論文の概要: BFRnet: A deep learning-based MR background field removal method for QSM
of the brain containing significant pathological susceptibility sources
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2204.02760v1
- Date: Wed, 6 Apr 2022 12:05:56 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2022-04-07 20:17:00.575098
- Title: BFRnet: A deep learning-based MR background field removal method for QSM
of the brain containing significant pathological susceptibility sources
- Title(参考訳): bfrnet : 有意な病態感受性源を含む脳のqsmに対する深層学習に基づくmr背景野除去法
- Authors: Xuanyu Zhu, Yang Gao, Feng Liu, Stuart Crozier, Hongfu Sun
- Abstract要約: 本研究は,健常者および出血患者の背景領域を除去するために,新たな深層学習ベース手法であるBFRnetを提案する。
ネットワークはU-netアーキテクチャ上の2周波数オクターブ畳み込みで構築され、重要な感受性源を含む合成フィールドマップで訓練されている。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 12.1082182773543
- License: http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
- Abstract: Introduction: Background field removal (BFR) is a critical step required for
successful quantitative susceptibility mapping (QSM). However, eliminating the
background field in brains containing significant susceptibility sources, such
as intracranial hemorrhages, is challenging due to the relatively large scale
of the field induced by these pathological susceptibility sources. Method: This
study proposes a new deep learning-based method, BFRnet, to remove background
field in healthy and hemorrhagic subjects. The network is built with the
dual-frequency octave convolutions on the U-net architecture, trained with
synthetic field maps containing significant susceptibility sources. The BFRnet
method is compared with three conventional BFR methods and one previous deep
learning method using simulated and in vivo brains from 4 healthy and 2
hemorrhagic subjects. Robustness against acquisition field-of-view (FOV)
orientation and brain masking are also investigated. Results: For both
simulation and in vivo experiments, BFRnet led to the best visually appealing
results in the local field and QSM results with the minimum contrast loss and
the most accurate hemorrhage susceptibility measurements among all five
methods. In addition, BFRnet produced the most consistent local field and
susceptibility maps between different sizes of brain masks, while conventional
methods depend drastically on precise brain extraction and further brain edge
erosions. It is also observed that BFRnet performed the best among all BFR
methods for acquisition FOVs oblique to the main magnetic field. Conclusion:
The proposed BFRnet improved the accuracy of local field reconstruction in the
hemorrhagic subjects compared with conventional BFR algorithms. The BFRnet
method was effective for acquisitions of titled orientations and retained whole
brains without edge erosion as often required by traditional BFR methods.
- Abstract(参考訳): 導入:背景野除去(BFR)は定量的感受性マッピング(QSM)の成功に必要な重要なステップである。
しかし,脳内出血などの重要な感受性源を含む脳の背景野の除去は,これらの病態感受性源によって引き起こされる磁場の比較的大きなスケールのため困難である。
方法:本研究では,健常者および出血患者の背景領域を除去するために,新たな深層学習に基づくBFRnetを提案する。
ネットワークはU-netアーキテクチャ上の2周波数オクターブ畳み込みで構築され、重要な感受性源を含む合成フィールドマップで訓練されている。
BFRnet法は,4名の健常者および2名の出血患者の脳を模擬・生体内脳を用いて,従来の3種類のBFR法と比較した。
獲得視野(FOV)指向と脳マスクに対するロバスト性についても検討した。
結果: シミュレーションと生体内実験の両方において, BFRnetは局所野において最も視覚的に魅力的な結果となり, QSMは最小コントラスト損失と最も正確な出血感受性の測定値を得た。
さらに、BFRnetは、脳マスクの大きさの異なる最も一貫した局所的および感受性マップを作成し、従来の方法は、正確な脳の抽出とさらなる脳の縁の浸食に大きく依存していた。
また、BFRnetは、主磁場に対して斜めにFOVを取得するために、すべてのBFR法の中で最善を尽くした。
結語:BFRnetは,従来のBFRアルゴリズムと比較して出血症例の局所的局所的再建の精度を向上した。
BFRnet法は、従来のBFR法でしばしば必要とされるように、エッジ侵食を伴わないタイトル指向の獲得に有効であった。
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