論文の概要: Exploring Robustness of Cortical Morphometry in the presence of white matter lesions, using Diffusion Models for Lesion Filling
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2503.20571v1
- Date: Wed, 26 Mar 2025 14:18:35 GMT
- ステータス: 翻訳完了
- システム内更新日: 2025-03-27 13:19:58.439454
- Title: Exploring Robustness of Cortical Morphometry in the presence of white matter lesions, using Diffusion Models for Lesion Filling
- Title(参考訳): 次元拡散モデルを用いた白質病変の存在下での皮質形態計測のロバストさの探索
- Authors: Vinzenz Uhr, Ivan Diaz, Christian Rummel, Richard McKinley,
- Abstract要約: 多発性硬化症や小血管疾患などのT1強調画像における白色物質の低強度は、脳の分画の出力に影響を与えることが知られている。
これらの効果は、従来の脳のセグメンテーションツールの間でよく文書化されているが、ディープラーニングセグメンテーションに基づくツールでは広く研究されていない。
本稿では,WM病変の存在下での皮質厚測定の精度と効率を高めるため,深層学習の可能性を検討する。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 0.1362941274535414
- License:
- Abstract: Cortical thickness measurements from magnetic resonance imaging, an important biomarker in many neurodegenerative and neurological disorders, are derived by many tools from an initial voxel-wise tissue segmentation. White matter (WM) hypointensities in T1-weighted imaging, such as those arising from multiple sclerosis or small vessel disease, are known to affect the output of brain segmentation methods and therefore bias cortical thickness measurements. These effects are well-documented among traditional brain segmentation tools but have not been studied extensively in tools based on deep-learning segmentations, which promise to be more robust. In this paper, we explore the potential of deep learning to enhance the accuracy and efficiency of cortical thickness measurement in the presence of WM lesions, using a high-quality lesion filling algorithm leveraging denoising diffusion networks. A pseudo-3D U-Net architecture trained on the OASIS dataset to generate synthetic healthy tissue, conditioned on binary lesion masks derived from the MSSEG dataset, allows realistic removal of white matter lesions in multiple sclerosis patients. By applying morphometry methods to patient images before and after lesion filling, we analysed robustness of global and regional cortical thickness measurements in the presence of white matter lesions. Methods based on a deep learning-based segmentation of the brain (Fastsurfer, DL+DiReCT, ANTsPyNet) exhibited greater robustness than those using classical segmentation methods (Freesurfer, ANTs).
- Abstract(参考訳): 多くの神経変性疾患や神経疾患において重要なバイオマーカーである磁気共鳴画像からの皮質の厚さの測定は、初期ボクセル単位の組織セグメンテーションから多くのツールから導かれる。
多発性硬化症や小血管疾患などのT1強調画像における白色物質(WM)の低強度は、脳のセグメンテーション法(英語版)の出力に影響を与えることが知られている。
これらの効果は、従来の脳のセグメンテーションツールの間でよく文書化されているが、より堅牢であることを約束するディープラーニングセグメンテーションに基づくツールでは、広く研究されていない。
本稿では, 深層学習の可能性を探り, 広帯域拡散ネットワークを利用した高品質な病変補充アルゴリズムを用いて, WM病変の存在下での皮質厚測定の精度と効率を高める。
OASISデータセットに基づいてトレーニングされた擬似3D U-Netアーキテクチャは、MSSEGデータセットから派生した2次元病変マスクに条件付けされた合成健全な組織を生成することで、多発性硬化症患者の白質病変を現実的に除去することができる。
病変充填前後の画像に形態計測法を適用し,白質病変の存在下での大脳皮質と局所皮質の厚さ測定の頑健さを解析した。
深層学習に基づく脳のセグメンテーション(Fastsurfer, DL+DiReCT, ANTsPyNet)に基づく手法は,古典的セグメンテーション法(Freesurfer, ANTs)よりも頑丈であった。
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