論文の概要: Enhancement on Model Interpretability and Sleep Stage Scoring
Performance with A Novel Pipeline Based on Deep Neural Network
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2204.03173v1
- Date: Thu, 7 Apr 2022 02:48:13 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2022-04-09 05:54:42.856175
- Title: Enhancement on Model Interpretability and Sleep Stage Scoring
Performance with A Novel Pipeline Based on Deep Neural Network
- Title(参考訳): ディープニューラルネットワークに基づく新しいパイプラインによるモデル解釈可能性の向上と睡眠ステージスコーリング性能
- Authors: Zheng Chen, Ziwei Yang, Ming Huang, Toshiyo Tamura, Naoaki Ono, MD
Altaf-Ul-Amin, Shigehiko Kanaya
- Abstract要約: 本稿では,アメリカ睡眠医学会の定義に従い,脳波(EEG)の表現学習のための時間周波数フレームワークを提案する。
入力された脳波スペクトログラムは、時間と周波数軸の一連のパッチに分割され、さらに表現学習を行うための繊細な深層学習ネットワークに入力される。
提案したパイプラインは、大規模なデータベース、すなわちSleep Heart Health Study (SHHS)に対して検証され、その結果、ウェイク、N2、N3ステージの競合性能が最先端の作業より優れていることが示された。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 4.296506281243336
- License: http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
- Abstract: Considering the natural frequency characteristics in sleep medicine, this
paper first proposes a time-frequency framework for the representation learning
of the electroencephalogram (EEG) following the definition of the American
Academy of Sleep Medicine. To meet the temporal-random and transient nature of
the defining characteristics of sleep stages, we further design a
context-sensitive flexible pipeline that automatically adapts to the attributes
of data itself. That is, the input EEG spectrogram is partitioned into a
sequence of patches in the time and frequency axes, and then input to a
delicate deep learning network for further representation learning to extract
the stage-dependent features, which are used in the classification step
finally. The proposed pipeline is validated against a large database, i.e., the
Sleep Heart Health Study (SHHS), and the results demonstrate that the
competitive performance for the wake, N2, and N3 stages outperforms the
state-of-art works, with the F1 scores being 0.93, 0.88, and 0.87,
respectively, and the proposed method has a high inter-rater reliability of
0.80 kappa. Importantly, we visualize the stage scoring process of the model
decision with the Layer-wise Relevance Propagation (LRP) method, which shows
that the proposed pipeline is more sensitive and perceivable in the
decision-making process than the baseline pipelines. Therefore, the pipeline
together with the LRP method can provide better model interpretability, which
is important for clinical support.
- Abstract(参考訳): 睡眠医学における自然周波数特性を考慮して,まず,アメリカ睡眠医学会の定義に従って脳波の表現学習(eeg)を行うための時間周波数枠組みを提案する。
睡眠段階の定義特性の時間的ランダム性と過渡性を満たすため,データ自体の属性に自動的に適応するコンテキスト依存型フレキシブルパイプラインを設計する。
すなわち、入力された脳波スペクトログラムを時間と周波数軸のパッチ列に分割し、さらに表現学習を行うための繊細な深層学習ネットワークに入力し、最終的に分類ステップで使用されるステージ依存的特徴を抽出する。
提案したパイプラインは,大規模なデータベース,すなわちSleep Heart Health Study (SHHS) に対して検証され,この結果,N2,N3ステージの競合性能は,それぞれ0.93,0.88,0.87のF1スコアで,それぞれ最先端の作業よりも優れており,その信頼性は0.80カッパであることがわかった。
重要なことは、モデル決定の段階的スコアリング過程をLayer-wise Relevance Propagation (LRP)法で視覚化し、提案したパイプラインがベースラインパイプラインよりも意思決定プロセスにおいてより敏感で知覚可能であることを示す。
したがって、lrp法と共にパイプラインは、臨床支援に重要なモデル解釈性を提供することができる。
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