論文の概要: InsMix: Towards Realistic Generative Data Augmentation for Nuclei
Instance Segmentation
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2206.15134v1
- Date: Thu, 30 Jun 2022 08:58:05 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2022-07-02 01:15:36.578315
- Title: InsMix: Towards Realistic Generative Data Augmentation for Nuclei
Instance Segmentation
- Title(参考訳): InsMix: Nucleiインスタンスセグメンテーションのための現実的な生成データ拡張を目指して
- Authors: Yi Lin, Zeyu Wang, Kwang-Ting Cheng, Hao Chen
- Abstract要約: 本稿では,コピック・ペースト・スムース原理に従って,核セグメンテーションのための現実的なデータ拡張手法InsMixを提案する。
具体的には、拡張画像が原子核に関する豪華な情報を取得することができる形態的制約を提案する。
背景の画素冗長性をフル活用するために,背景パッチをランダムにシャッフルする背景摂動法を提案する。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 29.78647170035808
- License: http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
- Abstract: Nuclei Segmentation from histology images is a fundamental task in digital
pathology analysis. However, deep-learning-based nuclei segmentation methods
often suffer from limited annotations. This paper proposes a realistic data
augmentation method for nuclei segmentation, named InsMix, that follows a
Copy-Paste-Smooth principle and performs morphology-constrained generative
instance augmentation. Specifically, we propose morphology constraints that
enable the augmented images to acquire luxuriant information about nuclei while
maintaining their morphology characteristics (e.g., geometry and location). To
fully exploit the pixel redundancy of the background and improve the model's
robustness, we further propose a background perturbation method, which randomly
shuffles the background patches without disordering the original nuclei
distribution. To achieve contextual consistency between original and template
instances, a smooth-GAN is designed with a foreground similarity encoder (FSE)
and a triplet loss. We validated the proposed method on two datasets, i.e.,
Kumar and CPS datasets. Experimental results demonstrate the effectiveness of
each component and the superior performance achieved by our method to the
state-of-the-art methods.
- Abstract(参考訳): 組織像からの核分離は、デジタル病理解析の基本的な課題である。
しかし、ディープラーニングベースの核セグメンテーションメソッドは、しばしば制限されたアノテーションに苦しむ。
本稿では,Copy-Paste-Smoothの原理に従い,形態制約付き生成インスタンス拡張を行う,InsMixという核分割のための現実的なデータ拡張手法を提案する。
具体的には,その形態特性(幾何学的特徴や位置など)を維持しつつ,原子核に関するラグジュラント情報を取得することができる形態制約を提案する。
さらに,背景の画素冗長性を十分に活用し,モデルの堅牢性を向上させるために,元の核分布を乱すことなく背景パッチをランダムにシャッフルする背景摂動法を提案する。
オリジナルインスタンスとテンプレートインスタンス間のコンテキスト整合性を達成するため、スムーズGANは前景類似性エンコーダ(FSE)とトリプルトロスで設計されている。
提案手法を2つのデータセット,すなわち Kumar と CPS のデータセット上で検証した。
実験により,各コンポーネントの有効性と,本手法の最先端手法に対する優れた性能が示された。
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