論文の概要: Weakly Supervised Medical Image Segmentation With Soft Labels and Noise
Robust Loss
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2209.08172v1
- Date: Fri, 16 Sep 2022 21:07:59 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2022-09-20 17:54:22.747656
- Title: Weakly Supervised Medical Image Segmentation With Soft Labels and Noise
Robust Loss
- Title(参考訳): ソフトラベルと雑音ロバスト損失を用いた弱教師付き医用画像分割
- Authors: Banafshe Felfeliyan, Abhilash Hareendranathan, Gregor Kuntze,
Stephanie Wichuk, Nils D. Forkert, Jacob L. Jaremko, and Janet L. Ronsky
- Abstract要約: ディープラーニングモデルのトレーニングには、エキスパートラベル付きアノテーションを備えた大規模なデータセットが一般的に必要である。
不正確なセグメンテーションラベルで訓練されたディープラーニングモデルを用いた画像ベースの医療診断ツールは、誤診断や治療提案につながる可能性がある。
本研究の目的は, マルチラターアノテーションとMRIにおける病変の特徴の解剖学的知識に基づいて, 確率ラベルを生成する手法を開発し, 評価することである。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 0.16490701092527607
- License: http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/
- Abstract: Recent advances in deep learning algorithms have led to significant benefits
for solving many medical image analysis problems. Training deep learning models
commonly requires large datasets with expert-labeled annotations. However,
acquiring expert-labeled annotation is not only expensive but also is
subjective, error-prone, and inter-/intra- observer variability introduces
noise to labels. This is particularly a problem when using deep learning models
for segmenting medical images due to the ambiguous anatomical boundaries.
Image-based medical diagnosis tools using deep learning models trained with
incorrect segmentation labels can lead to false diagnoses and treatment
suggestions. Multi-rater annotations might be better suited to train deep
learning models with small training sets compared to single-rater annotations.
The aim of this paper was to develop and evaluate a method to generate
probabilistic labels based on multi-rater annotations and anatomical knowledge
of the lesion features in MRI and a method to train segmentation models using
probabilistic labels using normalized active-passive loss as a "noise-tolerant
loss" function. The model was evaluated by comparing it to binary ground truth
for 17 knees MRI scans for clinical segmentation and detection of bone marrow
lesions (BML). The proposed method successfully improved precision 14, recall
22, and Dice score 8 percent compared to a binary cross-entropy loss function.
Overall, the results of this work suggest that the proposed normalized
active-passive loss using soft labels successfully mitigated the effects of
noisy labels.
- Abstract(参考訳): ディープラーニングアルゴリズムの最近の進歩は、多くの医療画像解析問題を解決するための大きな利点をもたらした。
ディープラーニングモデルのトレーニングは通常、専門家ラベル付きアノテーションを備えた大規模なデータセットを必要とする。
しかしながら、エキスパートラベルアノテーションの取得は高価であるばかりでなく、主観的、誤りやすい、そして、インター/イントラオブザーバの変動性がラベルにノイズをもたらす。
これは特に、あいまいな解剖学的境界による医学画像のセグメンテーションにディープラーニングモデルを使用する場合の問題である。
不正確なセグメンテーションラベルで訓練されたディープラーニングモデルを用いた画像ベースの医療診断ツールは、誤診断や治療提案につながる可能性がある。
マルチラタアノテーションは、シングルラタアノテーションと比較して、小さなトレーニングセットでディープラーニングモデルをトレーニングするのに適しています。
本研究の目的は,MRIにおける病変特徴のマルチラターアノテーションと解剖学的知識に基づいて確率ラベルを生成する手法の開発と評価と,正規化能動受動損失をノイズ耐性損失関数として用いた確率ラベルを用いたセグメンテーションモデルを訓練する方法である。
臨床分離法と骨髄病変検出法(BML)について, 膝関節MRI17例の2次的基底真理と比較し, 評価を行った。
提案手法は,2次クロスエントロピー損失関数と比較して精度14,22,Diceスコア8%の精度向上を実現した。
全体として, ソフトラベルを用いた正規化アクティブパッシブ損失は, ノイズラベルの効果を軽減できたことが示唆された。
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