論文の概要: DBGSL: Dynamic Brain Graph Structure Learning
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2209.13513v1
- Date: Tue, 27 Sep 2022 16:32:11 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2022-09-28 15:06:22.674699
- Title: DBGSL: Dynamic Brain Graph Structure Learning
- Title(参考訳): DBGSL: 動的脳グラフ構造学習
- Authors: Alexander Campbell, Antonio Giuliano Zippo, Luca Passamonti, Nicola
Toschi, Pietro Lio
- Abstract要約: 脳グラフの表現を学習するための動的脳グラフ構造学習(DBGSL)を提案する。
DBGSLは、脳領域埋め込みに適用された空間的時間的注意を通して、fMRIの時系列から動的グラフを学習する。
大きな休息状態とジェンダー分類のためのタスクfMRIデータセットの実験は、DBGSLが最先端のパフォーマンスを達成することを示す。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 58.94034282469377
- License: http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
- Abstract: Functional connectivity (FC) between regions of the brain is commonly
estimated through statistical dependency measures applied to functional
magnetic resonance imaging (fMRI) data. The resulting functional connectivity
matrix (FCM) is often taken to represent the adjacency matrix of a brain graph.
Recently, graph neural networks (GNNs) have been successfully applied to FCMs
to learn brain graph representations. A common limitation of existing GNN
approaches, however, is that they require the graph adjacency matrix to be
known prior to model training. As such, it is implicitly assumed the
ground-truth dependency structure of the data is known. Unfortunately, for fMRI
this is not the case as the choice of which statistical measure best represents
the dependency structure of the data is non-trivial. Also, most GNN
applications to fMRI assume FC is static over time, which is at odds with
neuroscientific evidence that functional brain networks are time-varying and
dynamic. These compounded issues can have a detrimental effect on the capacity
of GNNs to learn representations of brain graphs. As a solution, we propose
Dynamic Brain Graph Structure Learning (DBGSL), a supervised method for
learning the optimal time-varying dependency structure of fMRI data.
Specifically, DBGSL learns a dynamic graph from fMRI timeseries via
spatial-temporal attention applied to brain region embeddings. The resulting
graph is then fed to a spatial-temporal GNN to learn a graph representation for
classification. Experiments on large resting-state as well as task fMRI
datasets for the task of gender classification demonstrate that DBGSL achieves
state-of-the-art performance. Moreover, analysis of the learnt dynamic graphs
highlights prediction-related brain regions which align with findings from
existing neuroscience literature.
- Abstract(参考訳): 脳の領域間の機能的接続(FC)は、機能的磁気共鳴画像(fMRI)データに適用される統計的依存度によって推定される。
結果として生じる機能的接続行列(FCM)は、しばしば脳グラフの隣接行列を表す。
近年、グラフニューラルネットワーク(GNN)がFCMに適用され、脳グラフ表現の学習に成功している。
しかし、既存のGNNアプローチの一般的な制限は、モデルトレーニングの前にグラフ隣接行列を知っておく必要があることである。
そのため、データの基本構造が知られていることを暗黙的に仮定する。
残念なことに、fMRIでは、データの依存関係構造を最もよく表す統計測度の選択は自明ではないため、そうではない。
また、fmriへのほとんどのgnnアプリケーションは、fcが時間とともに静的であると仮定しており、機能的脳ネットワークが時間的かつ動的であるという神経科学的証拠とは相反する。
これらの複合問題は、脳グラフの表現を学習するGNNの能力に有害な影響を与える可能性がある。
そこで本研究では,fMRIデータの最適時間変化依存構造を学習するための教師付き手法である動的脳グラフ構造学習(DBGSL)を提案する。
特に、DBGSLは、脳領域埋め込みに適用された空間的時間的注意を通して、fMRIの時系列から動的グラフを学習する。
得られたグラフは空間時間GNNに送られ、分類のためのグラフ表現を学ぶ。
大きな休息状態とジェンダー分類のためのタスクfMRIデータセットの実験は、DBGSLが最先端のパフォーマンスを達成することを示す。
さらに、学習動的グラフの分析は、既存の神経科学文献から得られた知見と一致した予測関連脳領域を強調する。
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