論文の概要: Fitting a Directional Microstructure Model to Diffusion-Relaxation MRI
Data with Self-Supervised Machine Learning
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2210.02349v1
- Date: Wed, 5 Oct 2022 15:51:39 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2022-10-06 13:41:52.758815
- Title: Fitting a Directional Microstructure Model to Diffusion-Relaxation MRI
Data with Self-Supervised Machine Learning
- Title(参考訳): 自己監督機械学習による拡散緩和MRIデータへの方向構造モデルの適用
- Authors: Jason P. Lim and Stefano B. Blumberg and Neil Narayan and Sean C.
Epstein and Daniel C. Alexander and Marco Palombo and Paddy J. Slator
- Abstract要約: 教師付き学習の魅力的な代替手段として、自己教師型機械学習が登場している。
本稿では,指向性マイクロ構造モデルに適用可能な自己教師型機械学習モデルを実証する。
提案手法は, パラメータ推定と計算時間において, 通常の非線形最小二乗整合と比較して明らかに改善されている。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 2.8167227950959206
- License: http://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/4.0/
- Abstract: Machine learning is a powerful approach for fitting microstructural models to
diffusion MRI data. Early machine learning microstructure imaging
implementations trained regressors to estimate model parameters in a supervised
way, using synthetic training data with known ground truth. However, a drawback
of this approach is that the choice of training data impacts fitted parameter
values. Self-supervised learning is emerging as an attractive alternative to
supervised learning in this context. Thus far, both supervised and
self-supervised learning have typically been applied to isotropic models, such
as intravoxel incoherent motion (IVIM), as opposed to models where the
directionality of anisotropic structures is also estimated. In this paper, we
demonstrate self-supervised machine learning model fitting for a directional
microstructural model. In particular, we fit a combined T1-ball-stick model to
the multidimensional diffusion (MUDI) challenge diffusion-relaxation dataset.
Our self-supervised approach shows clear improvements in parameter estimation
and computational time, for both simulated and in-vivo brain data, compared to
standard non-linear least squares fitting. Code for the artificial neural net
constructed for this study is available for public use from the following
GitHub repository: https://github.com/jplte/deep-T1-ball-stick
- Abstract(参考訳): 機械学習は、微細構造モデルを拡散MRIデータに適用するための強力なアプローチである。
初期の機械学習マイクロ構造イメージングの実装は、既知の基底真理を持つ合成トレーニングデータを用いて、回帰器を訓練し、モデルパラメータを教師付き方法で推定した。
しかしながら、このアプローチの欠点は、トレーニングデータの選択がパラメータ値に適合することにある。
自己指導型学習は、この文脈における教師付き学習の魅力的な代替手段として現れつつある。
これまで、教師付き学習と自己教師型学習の両方が、異方性構造の方向性を推定するモデルとは対照的に、ボクセル内不整合運動(IVIM)のような等方性モデルに適用されてきた。
本稿では,方向性マイクロ構造モデルに適した自己教師あり機械学習モデルを提案する。
特に,多次元拡散(MUDI)課題拡散緩和データセットにT1-ball-stickモデルを組み合わせる。
自己教師あり手法は, 標準の非線形最小二乗法と比較して, シミュレーションデータと生体内データの両方において, パラメータ推定と計算時間は明らかに改善している。
この研究のために構築された人工ニューラルネットのコードは、次のgithubリポジトリから一般に利用可能である。
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