論文の概要: Whole-body tumor segmentation of 18F -FDG PET/CT using a cascaded and
ensembled convolutional neural networks
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2210.08068v1
- Date: Fri, 14 Oct 2022 19:25:56 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2022-10-18 18:01:00.235522
- Title: Whole-body tumor segmentation of 18F -FDG PET/CT using a cascaded and
ensembled convolutional neural networks
- Title(参考訳): 18F-FDG PET/CTのケースド・アンサンブル畳み込みニューラルネットワークによる全体腫瘍分節化
- Authors: Ludovic Sibille, Xinrui Zhan, and Lei Xiang
- Abstract要約: 本研究の目的は、18F-FDG PET/CT画像全体において癌疑い領域を自動的に分割するディープニューラルネットワークの性能を報告することである。
PET/CT画像を6mmの解像度で3D UNET CNNの重ね合わせで処理するケースドアプローチを開発した。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 2.735686397209314
- License: http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
- Abstract: Background: A crucial initial processing step for quantitative PET/CT
analysis is the segmentation of tumor lesions enabling accurate feature
ex-traction, tumor characterization, oncologic staging, and image-based therapy
response assessment. Manual lesion segmentation is however associated with
enormous effort and cost and is thus infeasible in clinical routine. Goal: The
goal of this study was to report the performance of a deep neural network
designed to automatically segment regions suspected of cancer in whole-body
18F-FDG PET/CT images in the context of the AutoPET challenge. Method: A
cascaded approach was developed where a stacked ensemble of 3D UNET CNN
processed the PET/CT images at a fixed 6mm resolution. A refiner network
composed of residual layers enhanced the 6mm segmentation mask to the original
resolution. Results: 930 cases were used to train the model. 50% were
histologically proven cancer patients and 50% were healthy controls. We
obtained a dice=0.68 on 84 stratified test cases. Manual and automatic
Metabolic Tumor Volume (MTV) were highly correlated (R2 = 0.969,Slope = 0.947).
Inference time was 89.7 seconds on average. Conclusion: The proposed algorithm
accurately segmented regions suspicious for cancer in whole-body 18F -FDG
PET/CT images.
- Abstract(参考訳): 背景: PET/CT定量化のための重要な初期処理ステップは, 正確な特徴抽出, 腫瘍の特徴解析, 腫瘍ステージング, 画像ベースの治療反応評価を可能にする腫瘍病変の分節化である。
しかし、手動病変の分節は膨大な労力とコストに関係しており、臨床のルーチンでは実現不可能である。
目的: この研究の目的は,AutoPET課題の文脈において,癌疑い領域を自動的に18F-FDG PET/CT画像に分割するディープニューラルネットワークの性能を報告することであった。
方法: 3d unet cnnの積層アンサンブルがpet/ct画像を固定6mmの解像度で処理するカスケード手法を開発した。
残留層からなる精製装置網は6mmセグメンテーションマスクを元の解像度に増強した。
結果: モデルのトレーニングには930例が使用された。
50%は組織学的に証明された癌患者で,50%は健康管理であった。
84例の層状化試験で, dice=0.68 が得られた。
手動および自動代謝腫瘍量(mtv)は高い相関を示した(r2 = 0.969,slope = 0.947)。
平均推定時間は89.7秒であった。
結論: 提案アルゴリズムは, 全18F-FDG PET/CT画像において, 癌を疑う領域を正確に分割する。
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