論文の概要: SUPRA: Superpixel Guided Loss for Improved Multi-modal Segmentation in
Endoscopy
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2211.04658v1
- Date: Wed, 9 Nov 2022 03:13:59 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2022-11-10 16:40:15.396989
- Title: SUPRA: Superpixel Guided Loss for Improved Multi-modal Segmentation in
Endoscopy
- Title(参考訳): 内視鏡下マルチモーダルセグメンテーション改善のための超ピクセル誘導損失法
- Authors: Rafael Martinez Garcia-Pe\~na, Mansoor Ali Teevno, Gilberto
Ochoa-Ruiz, Sharib Ali
- Abstract要約: ドメインシフトは医療画像コミュニティでよく知られた問題である。
本稿では,そのようなシナリオでDL手法が利用可能となるための領域一般化手法について検討する。
その結果,本手法では,ベースラインに比べて目標領域の25%近くの改善が得られた。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 1.1470070927586016
- License: http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
- Abstract: Domain shift is a well-known problem in the medical imaging community. In
particular, for endoscopic image analysis where the data can have different
modalities the performance of deep learning (DL) methods gets adversely
affected. In other words, methods developed on one modality cannot be used for
a different modality. However, in real clinical settings, endoscopists switch
between modalities for better mucosal visualisation. In this paper, we explore
the domain generalisation technique to enable DL methods to be used in such
scenarios. To this extend, we propose to use super pixels generated with Simple
Linear Iterative Clustering (SLIC) which we refer to as "SUPRA" for SUPeRpixel
Augmented method. SUPRA first generates a preliminary segmentation mask making
use of our new loss "SLICLoss" that encourages both an accurate and
color-consistent segmentation. We demonstrate that SLICLoss when combined with
Binary Cross Entropy loss (BCE) can improve the model's generalisability with
data that presents significant domain shift. We validate this novel compound
loss on a vanilla U-Net using the EndoUDA dataset, which contains images for
Barret's Esophagus and polyps from two modalities. We show that our method
yields an improvement of nearly 25% in the target domain set compared to the
baseline.
- Abstract(参考訳): ドメインシフトは医療画像コミュニティでよく知られた問題である。
特に、データが異なるモダリティを持つ内視鏡画像解析では、ディープラーニング(DL)手法の性能に悪影響を及ぼす。
言い換えれば、1つのモダリティで開発されたメソッドは異なるモダリティには使用できない。
しかし、実際の臨床環境では、内視鏡医は粘膜の視認性を改善するためにモダリティを切り替える。
本稿では,このようなシナリオでdlメソッドを使用できるドメイン一般化手法について検討する。
この拡張のために, SUPeRpixel Augmented 法では "SUPRA" と呼ぶ, Simple Linear Iterative Clustering (SLIC) で生成されたスーパーピクセルを提案する。
supraはまず,新しい損失"スライス"を利用したプリミティブセグメンテーションマスクを生成し,精度と色に一貫性のあるセグメンテーションを奨励する。
SLICLossとバイナリクロスエントロピー損失(BCE)を組み合わせることで、大きなドメインシフトを示すデータによるモデルの一般化性を向上させることができることを示す。
本研究では,バレット食道とポリープの画像を含むEndoUDAデータセットを用いて,バニラU-Net上の新規化合物の損失を検証する。
その結果,本手法では,ベースラインに比べて目標領域の25%近くの改善が得られた。
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