論文の概要: Double U-Net for Super-Resolution and Segmentation of Live Cell Images
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2212.02028v1
- Date: Mon, 5 Dec 2022 04:55:15 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2022-12-06 18:35:13.862731
- Title: Double U-Net for Super-Resolution and Segmentation of Live Cell Images
- Title(参考訳): ライブセル画像の超解像とセグメンテーションのためのダブルu-net
- Authors: Mayur Bhandary, J. Patricio Reyes, Eylul Ertay, Aman Panda
- Abstract要約: 深層学習法は高い精度で細胞セグメンテーションを行うことができる。
しかし、これを行うために機械学習モデルを開発するには、生きた細胞の高忠実度画像にアクセスする必要がある。
これは、高性能顕微鏡へのアクセシビリティの制限や、研究対象の生物の性質によるリソース制約のため、しばしば利用できない。
本稿では,前処理ステップとして超解像処理を行うことにより,低解像度画像を用いたライブセル分割を実現する手法を提案する。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 0.0
- License: http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
- Abstract: Accurate segmentation of live cell images has broad applications in clinical
and research contexts. Deep learning methods have been able to perform cell
segmentations with high accuracy; however developing machine learning models to
do this requires access to high fidelity images of live cells. This is often
not available due to resource constraints like limited accessibility to high
performance microscopes or due to the nature of the studied organisms.
Segmentation on low resolution images of live cells is a difficult task. This
paper proposes a method to perform live cell segmentation with low resolution
images by performing super-resolution as a pre-processing step in the
segmentation pipeline.
- Abstract(参考訳): ライブセル画像の正確なセグメンテーションは、臨床および研究の文脈に広く応用されている。
深層学習法は高い精度で細胞セグメンテーションを実行することができるが、それを行う機械学習モデルの開発には、生きた細胞の高忠実度画像へのアクセスが必要である。
これは、高性能顕微鏡へのアクセシビリティの制限や、研究対象の生物の性質によるリソース制約のため、しばしば利用できない。
ライブセルの低解像度画像へのセグメンテーションは難しい作業である。
本稿では,セグメンテーションパイプラインの事前処理ステップとして超解像を行うことにより,低解像度画像を用いたライブセルセグメンテーションを行う手法を提案する。
関連論文リスト
- Cell as Point: One-Stage Framework for Efficient Cell Tracking [54.19259129722988]
本稿では,一段階の効率的なセルトラッキングを実現するために,新しいエンドツーエンドCAPフレームワークを提案する。
CAPは検出またはセグメンテーション段階を放棄し、細胞点の軌跡間の相関を利用して細胞を共同で追跡することでプロセスを単純化する。
Capは強力なセルトラッキング性能を示し、既存の方法の10倍から55倍の効率を示している。
論文 参考訳(メタデータ) (2024-11-22T10:16:35Z) - SaccadeDet: A Novel Dual-Stage Architecture for Rapid and Accurate Detection in Gigapixel Images [50.742420049839474]
SaccadeDetは、人間の目の動きにインスパイアされた、ギガピクセルレベルの物体検出のための革新的なアーキテクチャである。
PANDAデータセットを用いて評価した本手法は,最先端手法の8倍の高速化を実現する。
また、全スライドイメージングへの応用を通じて、ギガピクセルレベルの病理解析に有意な可能性を示す。
論文 参考訳(メタデータ) (2024-07-25T11:22:54Z) - CellMixer: Annotation-free Semantic Cell Segmentation of Heterogeneous
Cell Populations [9.335273591976648]
異種細胞集団のセマンティックセグメンテーションのための革新的なアノテーションのないアプローチであるCellMixerを提案する。
以上の結果から,CellMixerは複数のセルタイプにまたがる競合セグメンテーション性能と画像モダリティを実現することができることがわかった。
論文 参考訳(メタデータ) (2023-12-01T15:50:20Z) - Multi-stream Cell Segmentation with Low-level Cues for Multi-modality
Images [66.79688768141814]
我々は,顕微鏡画像のラベル付けを行うセル分類パイプラインを開発した。
次に、分類ラベルに基づいて分類モデルを訓練する。
2種類のセグメンテーションモデルを、丸みを帯びた形状と不規則な形状のセグメンテーションセルに展開する。
論文 参考訳(メタデータ) (2023-10-22T08:11:08Z) - Affine-Consistent Transformer for Multi-Class Cell Nuclei Detection [76.11864242047074]
本稿では, 原子核位置を直接生成する新しいアフィン一貫性変換器 (AC-Former) を提案する。
本稿では,AAT (Adaptive Affine Transformer) モジュールを導入し,ローカルネットワークトレーニングのためのオリジナル画像をワープするための重要な空間変換を自動学習する。
実験結果から,提案手法は様々なベンチマークにおいて既存の最先端アルゴリズムを著しく上回ることがわかった。
論文 参考訳(メタデータ) (2023-10-22T02:27:02Z) - The Multi-modality Cell Segmentation Challenge: Towards Universal Solutions [26.613802004468578]
このベンチマークは、50以上の生物実験の1500以上のラベル付き画像で構成されている。
上位の参加者は、既存の手法を超越したTransformerベースのディープラーニングアルゴリズムを開発した。
このベンチマークと改良されたアルゴリズムは、顕微鏡画像におけるより正確で多用途な細胞解析のための有望な道を提供する。
論文 参考訳(メタデータ) (2023-08-10T21:59:23Z) - EfficientCellSeg: Efficient Volumetric Cell Segmentation Using Context
Aware Pseudocoloring [4.555723508665994]
ボリュームセルセグメンテーションのための小さな畳み込みニューラルネットワーク(CNN)を導入する。
我々のモデルは効率的で非対称なエンコーダ・デコーダ構造を持ち、デコーダにはほとんどパラメータがない。
我々のCNNモデルは,他の上位手法に比べて最大25倍のパラメータ数を持つ。
論文 参考訳(メタデータ) (2022-04-06T18:02:15Z) - Cell segmentation from telecentric bright-field transmitted light
microscopic images using a Residual Attention U-Net: a case study on HeLa
line [0.0]
明視野光顕微鏡画像からのリビング細胞分画は、生体細胞の画像の複雑さと時間的変化のために困難である。
近年, 深層学習(DL)に基づく手法が, その成功と有望な成果により, 医用・顕微鏡画像分割作業で普及している。
本研究の目的は,HeLa線の生きた細胞を光電場透過顕微鏡で分断する深層学習型UNet法を開発することである。
論文 参考訳(メタデータ) (2022-03-23T09:20:30Z) - Towards an Automatic Analysis of CHO-K1 Suspension Growth in
Microfluidic Single-cell Cultivation [63.94623495501023]
我々は、人間の力で抽象化されたニューラルネットワークをデータレベルで注入できる新しい機械学習アーキテクチャを提案する。
具体的には、自然データと合成データに基づいて生成モデルを同時に訓練し、細胞数などの対象変数を確実に推定できる共有表現を学習する。
論文 参考訳(メタデータ) (2020-10-20T08:36:51Z) - Image segmentation via Cellular Automata [58.86475603234583]
我々は高解像度画像のセグメンテーションを成功させるセルオートマトンを設計し、訓練する。
私たちの最小のオートマトンは、複雑なセグメンテーションタスクを解決するために1万以下のパラメータを使用します。
論文 参考訳(メタデータ) (2020-08-11T19:04:09Z) - Learning to segment clustered amoeboid cells from brightfield microscopy
via multi-task learning with adaptive weight selection [6.836162272841265]
マルチタスク学習パラダイムにおけるセルセグメンテーションのための新しい教師付き手法を提案する。
ネットワークの予測効率を向上させるために、領域とセル境界検出に基づくマルチタスク損失の組み合わせを用いる。
検証セットで全体のDiceスコアが0.93であり、これは最近の教師なし手法で15.9%以上の改善であり、一般的な教師付きU-netアルゴリズムを平均5.8%以上上回っている。
論文 参考訳(メタデータ) (2020-05-19T11:31:53Z)
関連論文リストは本サイト内にある論文のタイトル・アブストラクトから自動的に作成しています。
指定された論文の情報です。
本サイトの運営者は本サイト(すべての情報・翻訳含む)の品質を保証せず、本サイト(すべての情報・翻訳含む)を使用して発生したあらゆる結果について一切の責任を負いません。