論文の概要: Multimodal CNN Networks for Brain Tumor Segmentation in MRI: A BraTS
2022 Challenge Solution
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2212.09310v1
- Date: Mon, 19 Dec 2022 09:14:23 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2022-12-20 15:53:42.051214
- Title: Multimodal CNN Networks for Brain Tumor Segmentation in MRI: A BraTS
2022 Challenge Solution
- Title(参考訳): MRIにおける脳腫瘍分離のためのマルチモーダルCNNネットワーク:BraTS 2022チャレンジソリューション
- Authors: Ramy A. Zeineldin, Mohamed E. Karar, Oliver Burgert, Franziska
Mathis-Ullrich
- Abstract要約: この記事では、BraTS 2022の継続的評価課題への私たちの貢献について説明する。
術前MRIにおけるグリオーマ境界の自動検出のための,DeepSeg,nnU-Net,DeepSCANという,複数のディープラーニングフレームワークのアンサンブルを提案する。
Diceスコアが0.9294、0.8788、0.8803、Hausdorf距離が5.23、13.54、12.05のBraTSテストデータセットで、腫瘍全体、腫瘍コア、造影腫瘍をそれぞれ評価した。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 0.0
- License: http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
- Abstract: Automatic segmentation is essential for the brain tumor diagnosis, disease
prognosis, and follow-up therapy of patients with gliomas. Still, accurate
detection of gliomas and their sub-regions in multimodal MRI is very
challenging due to the variety of scanners and imaging protocols. Over the last
years, the BraTS Challenge has provided a large number of multi-institutional
MRI scans as a benchmark for glioma segmentation algorithms. This paper
describes our contribution to the BraTS 2022 Continuous Evaluation challenge.
We propose a new ensemble of multiple deep learning frameworks namely, DeepSeg,
nnU-Net, and DeepSCAN for automatic glioma boundaries detection in
pre-operative MRI. It is worth noting that our ensemble models took first place
in the final evaluation on the BraTS testing dataset with Dice scores of
0.9294, 0.8788, and 0.8803, and Hausdorf distance of 5.23, 13.54, and 12.05,
for the whole tumor, tumor core, and enhancing tumor, respectively.
Furthermore, the proposed ensemble method ranked first in the final ranking on
another unseen test dataset, namely Sub-Saharan Africa dataset, achieving mean
Dice scores of 0.9737, 0.9593, and 0.9022, and HD95 of 2.66, 1.72, 3.32 for the
whole tumor, tumor core, and enhancing tumor, respectively. The docker image
for the winning submission is publicly available at
(https://hub.docker.com/r/razeineldin/camed22).
- Abstract(参考訳): グリオーマ患者の脳腫瘍診断,疾患予後,経過観察には,自動セグメンテーションが不可欠である。
それでも,マルチモーダルMRIにおけるグリオーマとそのサブ領域の正確な検出は非常に困難である。
ここ数年、BraTS Challengeはグリオーマセグメンテーションアルゴリズムのベンチマークとして、多施設MRIスキャンを多数提供してきた。
本稿では,brats 2022連続評価課題への貢献について述べる。
術前MRIにおけるグリオーマ境界の自動検出のための,DeepSeg,nnU-Net,DeepSCANという,複数のディープラーニングフレームワークのアンサンブルを提案する。
また, 腫瘍, 腫瘍コア, 造影腫瘍全例について, diceスコア0.9294, 0.8788, 0.8803, ハウスドルフ距離5.23, 13.54, 12.05のブラッツテストデータセットを最終評価した。
さらに,提案したアンサンブル法は,サハラ以南のアフリカ亜種データセットにおいて,腫瘍全体,腫瘍コア,造影腫瘍に対するDiceスコアが0.9737,0.9593,0.9022,HD95が2.66,1.72,332であった。
受賞作品のdockerイメージは(https://hub.docker.com/r/razeineldin/camed22)公開されている。
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