論文の概要: BayeSeg: Bayesian Modeling for Medical Image Segmentation with
Interpretable Generalizability
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2303.01710v1
- Date: Fri, 3 Mar 2023 04:48:37 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2023-03-06 16:11:04.276284
- Title: BayeSeg: Bayesian Modeling for Medical Image Segmentation with
Interpretable Generalizability
- Title(参考訳): BayeSeg: 解釈可能な一般化性を持つ医用画像分割のためのベイジアンモデリング
- Authors: Shangqi Gao and Hangqi Zhou and Yibo Gao and Xiahai Zhuang
- Abstract要約: 医用画像分割のためのモデル一般化性を高めるための解釈可能なベイズフレームワーク(BayeSeg)を提案する。
具体的には、まず、画像を空間的関連変数と空間的変動変数に分解し、階層的ベイズ事前を割り当て、それぞれドメインの安定な形状とドメイン固有の外観情報をモデル化するよう明示的に強制する。
最後に、これらの説明可能な変数の後方分布を推測する変分ベイズ的枠組みを開発する。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 15.410162313242958
- License: http://arxiv.org/licenses/nonexclusive-distrib/1.0/
- Abstract: Due to the cross-domain distribution shift aroused from diverse medical
imaging systems, many deep learning segmentation methods fail to perform well
on unseen data, which limits their real-world applicability. Recent works have
shown the benefits of extracting domain-invariant representations on domain
generalization. However, the interpretability of domain-invariant features
remains a great challenge. To address this problem, we propose an interpretable
Bayesian framework (BayeSeg) through Bayesian modeling of image and label
statistics to enhance model generalizability for medical image segmentation.
Specifically, we first decompose an image into a spatial-correlated variable
and a spatial-variant variable, assigning hierarchical Bayesian priors to
explicitly force them to model the domain-stable shape and domain-specific
appearance information respectively. Then, we model the segmentation as a
locally smooth variable only related to the shape. Finally, we develop a
variational Bayesian framework to infer the posterior distributions of these
explainable variables. The framework is implemented with neural networks, and
thus is referred to as deep Bayesian segmentation. Quantitative and qualitative
experimental results on prostate segmentation and cardiac segmentation tasks
have shown the effectiveness of our proposed method. Moreover, we investigated
the interpretability of BayeSeg by explaining the posteriors and analyzed
certain factors that affect the generalization ability through further ablation
studies. Our code will be released via https://zmiclab.github.io/projects.html,
once the manuscript is accepted for publication.
- Abstract(参考訳): 多様な医用画像システムから引き起こされたクロスドメイン分布シフトのため、多くのディープラーニングセグメンテーション手法は、実際の適用性を制限する未発見のデータではうまく機能しない。
近年の研究では、ドメイン一般化におけるドメイン不変表現を抽出する利点が示されている。
しかし、ドメイン不変な特徴の解釈性は依然として大きな課題である。
この問題に対処するために,ベイジアンによる画像とラベル統計のモデリングによる解釈可能なベイジアンフレームワーク(ベイジセグ)を提案し,医用画像セグメンテーションのモデル一般化性を向上させる。
具体的には、まず、画像を空間相関変数と空間可変変数に分解し、階層ベイズ前駆者を割り当てて、それぞれドメイン安定形状とドメイン固有外観情報をモデル化させる。
次に,セグメント化を形状のみに関連する局所的滑らかな変数としてモデル化する。
最後に、これらの説明可能な変数の後方分布を推測する変分ベイズ的枠組みを開発する。
このフレームワークはニューラルネットワークで実装されており、ディープベイズセグメンテーション(deep bayesian segmentation)と呼ばれる。
前立腺セグメンテーションと心臓セグメンテーションタスクの定量的および定性的な実験結果から,本手法の有効性が示された。
さらに,後肢の解釈について検討し,さらなるアブレーション研究を通じて一般化能力に影響する要因を分析した。
私たちのコードはhttps://zmiclab.github.io/projects.htmlでリリースされます。
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