論文の概要: EGFR mutation prediction using F18-FDG PET-CT based radiomics features
in non-small cell lung cancer
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2303.08569v1
- Date: Tue, 14 Mar 2023 01:25:54 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2023-03-16 13:49:25.969755
- Title: EGFR mutation prediction using F18-FDG PET-CT based radiomics features
in non-small cell lung cancer
- Title(参考訳): 非小細胞肺癌におけるF18-FDG PET-CTを用いたEGFR変異予測
- Authors: Hector Henriquez, Diana Fuentes, Francisco Suarez, Patricio Gonzalez
- Abstract要約: 本研究の目的は,PET-CT画像から抽出した放射線学的特徴を用いた非小細胞肺癌患者のEGFRの変異状況を予測することである。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 0.0
- License: http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
- Abstract: Lung cancer is the leading cause of cancer death in the world. Accurate
determination of the EGFR (epidermal growth factor receptor) mutation status is
highly relevant for the proper treatment of this patients. Purpose: The aim of
this study was to predict the mutational status of the EGFR in non-small cell
lung cancer patients using radiomics features extracted from PET-CT images.
Methods: Retrospective study that involve 34 patients with lung cancer
confirmed by histology and EGFR status mutation assessment. A total of 2.205
radiomics features were extracted from manual segmentation of the PET-CT images
using pyradiomics library. Both computed tomography and positron emission
tomography images were used. All images were acquired with intravenous
iodinated contrast and F18-FDG. Preprocessing includes resampling,
normalization, and discretization of the pixel intensity. Three methods were
used for the feature selection process: backward selection (set 1), forward
selection (set 2), and feature importance analysis of random forest model (set
3). Nine machine learning methods were used for radiomics model building.
Results: 35.2% of patients had EGFR mutation, without significant differences
in age, gender, tumor size and SUVmax. After the feature selection process 6, 7
and 17 radiomics features were selected, respectively in each group. The best
performances were obtained by Ridge Regression in set 1: AUC of 0.826 (95% CI,
0.811 - 0.839), Random Forest in set 2: AUC of 0.823 (95% CI, 0.808 - 0.838)
and Neural Network in set 3: AUC of 0.821 (95% CI, 0.808 - 0.835). Conclusion:
The radiomics features analysis has the potential of predicting clinically
relevant mutations in lung cancer patients through a non-invasive methodology.
- Abstract(参考訳): 肺がんは世界でもがん死の主な原因である。
EGFR (epidermal growth factor receptor) 変異の正確な判定は, 本症例の適切な治療に極めて重要である。
目的:PET-CT画像から抽出した放射線学的特徴を用いて,非小細胞肺癌患者のEGFRの変異状況を予測することを目的とした。
方法: 肺がん患者34名を対象に, 病理組織学的, EGFR像の変異評価を行った。
PET-CT画像の2.205個の放射能の特徴をピラディオミクスライブラリーを用いて抽出した。
コンピュータ断層撮影とポジトロン放射断層撮影の両方が用いられた。
すべての画像は静脈内ヨウ素化コントラストとf18-fdgで得られた。
前処理には再サンプリング、正規化、画素強度の離散化が含まれる。
特徴選択には, 後方選択法(セット1), 前方選択法(セット2), ランダムフォレストモデル(セット3)の特徴重要度解析法(セット3)の3つの方法が用いられた。
放射線モデル構築には9つの機械学習手法が用いられた。
結果: egfr変異は35.2%で, 年齢, 性別, 腫瘍サイズ, suvmaxに有意差はなかった。
特徴選択処理6,7,17の放射能特徴をそれぞれグループ毎に選択した。
最高のパフォーマンスは、Rook Regression in set 1: AUC of 0.826 (95% CI, 0.811 - 0.839)、Random Forest in set 2: AUC of 0.823 (95% CI, 0.808 - 0.838)、Neural Network in set 3: AUC of 0.821 (95% CI, 0.808 - 0.835)である。
結論:radiomics feature analysisは非侵襲的手法によって肺癌患者の臨床的に関連のある突然変異を予測する可能性を秘めている。
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