論文の概要: Exploring contrast generalisation in deep learning-based brain MRI-to-CT
synthesis
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2303.10202v1
- Date: Fri, 17 Mar 2023 18:45:05 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2023-03-21 20:40:47.699465
- Title: Exploring contrast generalisation in deep learning-based brain MRI-to-CT
synthesis
- Title(参考訳): 深層学習に基づく脳MRI-to-CT合成におけるコントラスト一般化の探索
- Authors: Lotte Nijskens, Cornelis (Nico) AT van den Berg, Joost JC Verhoeff,
Matteo Maspero
- Abstract要約: MRIプロトコルは、経時的に変化するか、または低品質のsCTをもたらすセンターによって異なる可能性がある。
ドメインランダム化(DR)は、脳sCT生成のためのDLモデルの一般化を増大させる。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 0.0
- License: http://arxiv.org/licenses/nonexclusive-distrib/1.0/
- Abstract: Background: Synthetic computed tomography (sCT) has been proposed and
increasingly clinically adopted to enable magnetic resonance imaging
(MRI)-based radiotherapy. Deep learning (DL) has recently demonstrated the
ability to generate accurate sCT from fixed MRI acquisitions. However, MRI
protocols may change over time or differ between centres resulting in
low-quality sCT due to poor model generalisation. Purpose: investigating domain
randomisation (DR) to increase the generalisation of a DL model for brain sCT
generation. Methods: CT and corresponding T1-weighted MRI with/without
contrast, T2-weighted, and FLAIR MRI from 95 patients undergoing RT were
collected, considering FLAIR the unseen sequence where to investigate
generalisation. A ``Baseline'' generative adversarial network was trained
with/without the FLAIR sequence to test how a model performs without DR. Image
similarity and accuracy of sCT-based dose plans were assessed against CT to
select the best-performing DR approach against the Baseline. Results: The
Baseline model had the poorest performance on FLAIR, with mean absolute error
(MAE)=106$\pm$20.7 HU (mean$\pm\sigma$). Performance on FLAIR significantly
improved for the DR model with MAE=99.0$\pm$14.9 HU, but still inferior to the
performance of the Baseline+FLAIR model (MAE=72.6$\pm$10.1 HU). Similarly, an
improvement in $\gamma$-pass rate was obtained for DR vs Baseline. Conclusions:
DR improved image similarity and dose accuracy on the unseen sequence compared
to training only on acquired MRI. DR makes the model more robust, reducing the
need for re-training when applying a model on sequences unseen and unavailable
for retraining.
- Abstract(参考訳): 背景: シンセティック・コンピュート・トモグラフィー(sCT)が提案され, MRIベースの放射線治療を可能にするために臨床応用が進んでいる。
深層学習(DL)は、最近MRIの固定取得から正確なsCTを生成する能力を示した。
しかし、MRIプロトコルは時間とともに変化するか、あるいはモデル一般化が不十分なため、低品質のsCTが生じる。
目的:脳sCT生成のためのDLモデルの一般化を促進するために、ドメインランダム化(DR)を調査すること。
方法】rtを施行した95例のctおよびそれに対応するt1強調mri,t2強調mriおよびflair mriを,一般化を検討すべき未発見配列を考慮に入れて収集した。
画像の類似性やsctベースの線量計画の精度をctに対して評価し、ベースラインに対して最適なdrアプローチを選択する。
結果: Baseline モデルは FLAIR において,平均絶対誤差 (MAE)=106$\pm$20.7 HU (mean$\pm\sigma$) が最も低かった。
FLAIRの性能はMAE=99.0$\pm$14.9 HUで大幅に改善されたが、ベースライン+FLAIRモデル(MAE=72.6$\pm$10.1 HU)よりは劣った。
同様に、DR対Baselineでは$\gamma$-passレートの改善が得られた。
結語: DRは画像の類似度と線量精度を、取得したMRIでのみ訓練した場合と比較して改善した。
DRにより、モデルはより堅牢になり、再トレーニングのできないシーケンスにモデルを適用する際の再トレーニングの必要性が軽減される。
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