論文の概要: SFHarmony: Source Free Domain Adaptation for Distributed Neuroimaging
Analysis
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2303.15965v1
- Date: Tue, 28 Mar 2023 13:35:10 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2023-03-29 15:09:43.145911
- Title: SFHarmony: Source Free Domain Adaptation for Distributed Neuroimaging
Analysis
- Title(参考訳): SFHarmony:分散神経画像解析のためのソースフリードメイン適応
- Authors: Nicola K Dinsdale, Mark Jenkinson, Ana IL Namburete
- Abstract要約: 異なるMRIスキャナーは、異なる特徴を持つ画像を生成し、調和問題として知られる領域シフトをもたらす」。
本研究では、これらの障壁を克服するために、SFHarmony法(Unsupervised Source-Free Domain Adaptation, SFDA)を提案する。
我々の手法は、さまざまな現実的なデータシナリオにおいて、既存のSFDAアプローチよりも優れています。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 2.371982686172067
- License: http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
- Abstract: To represent the biological variability of clinical neuroimaging populations,
it is vital to be able to combine data across scanners and studies. However,
different MRI scanners produce images with different characteristics, resulting
in a domain shift known as the `harmonisation problem'. Additionally,
neuroimaging data is inherently personal in nature, leading to data privacy
concerns when sharing the data. To overcome these barriers, we propose an
Unsupervised Source-Free Domain Adaptation (SFDA) method, SFHarmony. Through
modelling the imaging features as a Gaussian Mixture Model and minimising an
adapted Bhattacharyya distance between the source and target features, we can
create a model that performs well for the target data whilst having a shared
feature representation across the data domains, without needing access to the
source data for adaptation or target labels. We demonstrate the performance of
our method on simulated and real domain shifts, showing that the approach is
applicable to classification, segmentation and regression tasks, requiring no
changes to the algorithm. Our method outperforms existing SFDA approaches
across a range of realistic data scenarios, demonstrating the potential utility
of our approach for MRI harmonisation and general SFDA problems. Our code is
available at \url{https://github.com/nkdinsdale/SFHarmony}.
- Abstract(参考訳): 臨床画像集団の生物学的多様性を表現するためには,スキャナと研究をまたいだデータを組み合わせることが不可欠である。
しかし、異なるMRIスキャナは異なる特徴を持つ画像を生成するため、「調和問題」と呼ばれる領域シフトが生じる。
さらに、Neuroimaging dataは本質的に個人的であり、データを共有する際のプライバシー上の懸念につながります。
これらの障壁を克服するため,SFHarmony を用いた Unsupervised Source-Free Domain Adaptation (SFDA) 手法を提案する。
画像特徴をガウス混合モデルとしてモデル化し、ソースとターゲット特徴の間の適応したバッタリア距離を最小化することにより、適応やターゲットラベルのソースデータにアクセスすることなく、データ領域間で共有された特徴表現を持ちながら、ターゲットデータに対して良好に機能するモデルを作成することができる。
シミュレーションおよび実領域シフトにおける本手法の性能を実証し,アルゴリズムの変更を必要とせず,分類,セグメント化,回帰処理に適用可能であることを示す。
提案手法は,MRIの調和や一般のSFDA問題に対するアプローチの有用性を実証し,既存のSFDAアプローチよりも優れていることを示す。
私たちのコードは \url{https://github.com/nkdinsdale/SFHarmony} で利用可能です。
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