論文の概要: Predicting dynamic, motion-related changes in B0 field in the brain at a
7 T MRI using a subject-specific fine-tuned U-net
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2304.08307v1
- Date: Mon, 17 Apr 2023 14:23:09 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2023-04-18 14:48:41.302513
- Title: Predicting dynamic, motion-related changes in B0 field in the brain at a
7 T MRI using a subject-specific fine-tuned U-net
- Title(参考訳): 被検体特異的微調整U-netを用いた7 T MRIにおける脳内B0野の動的・運動関連変化の予測
- Authors: Stanislav Motyka, Paul Weiser, Beata Bachrata, Lukas Hingerl, Bernhard
Strasser, Gilbert Hangel, Eva Niess, Dario Goranovic, Fabian Niess, Maxim
Zaitsev, Simon Daniel Robinson, Georg Langs, Siegfried Trattnig, Wolfgang
Bogner
- Abstract要約: 本稿では,頭部位置の変化から脳内の変化を予測する手法を提案する。
3D U-netは、生体内脳7T MRIデータに基づいて訓練された。
剛体運動からB0マップを予測することは可能であり、外部追跡ハードウェアと組み合わせることで、ナビゲータを使わずに磁気共鳴取得の品質を向上させることができる。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 1.4621390703480015
- License: http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
- Abstract: Subject movement during the magnetic resonance examination is inevitable and
causes not only image artefacts but also deteriorates the homogeneity of the
main magnetic field (B0), which is a prerequisite for high quality data. Thus,
characterization of changes to B0, e.g. induced by patient movement, is
important for MR applications that are prone to B0 inhomogeneities. We propose
a deep learning based method to predict such changes within the brain from the
change of the head position to facilitate retrospective or even real-time
correction. A 3D U-net was trained on in vivo brain 7T MRI data. The input
consisted of B0 maps and anatomical images at an initial position, and
anatomical images at a different head position (obtained by applying a
rigid-body transformation on the initial anatomical image). The output
consisted of B0 maps at the new head positions. We further fine-tuned the
network weights to each subject by measuring a limited number of head positions
of the given subject, and trained the U-net with these data. Our approach was
compared to established dynamic B0 field mapping via interleaved navigators,
which suffer from limited spatial resolution and the need for undesirable
sequence modifications. Qualitative and quantitative comparison showed similar
performance between an interleaved navigator-equivalent method and proposed
method. We therefore conclude that it is feasible to predict B0 maps from rigid
subject movement and, when combined with external tracking hardware, this
information could be used to improve the quality of magnetic resonance
acquisitions without the use of navigators.
- Abstract(参考訳): 磁気共鳴検査中の被写体の動きは避けられず、画像アーティファクトだけでなく、高品質データの前提条件である主磁場(b0)の均一性を低下させる。
したがって、患者運動によって引き起こされるB0の変化の特徴は、B0の不均一性に起因したMRアプリケーションにとって重要である。
本研究では,脳内におけるこのような変化を頭部位置の変化から予測し,振り返りやリアルタイムの修正を促進する深層学習に基づく手法を提案する。
3d u-netはin vivo brain 7t mriデータで訓練された。
入力は、初期位置のB0マップと解剖画像と、異なる頭部位置の解剖画像(初期解剖画像に剛体変換を適用することにより得られる)から構成された。
出力は新しいヘッド位置のB0マップで構成された。
さらに,対象者の頭部位置を限定的に測定することで,各被験者のネットワーク重量を微調整し,これらのデータを用いてU-netを訓練した。
提案手法は,空間分解能の制限と望ましくないシーケンス修正の必要性に苦しむインターリーブナビゲータによる動的b0フィールドマッピングと比較した。
定性的および定量的に比較した結果,インターリーブナビゲータ等価法と提案法で同等の性能を示した。
したがって、剛体運動からb0マップを予測することは可能であり、外部追跡ハードウェアと組み合わせることで、ナビゲータを使わずに磁気共鳴取得の質を向上させることができると結論づける。
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