論文の概要: Transformer-based Time-to-Event Prediction for Chronic Kidney Disease
Deterioration
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2306.05779v1
- Date: Fri, 9 Jun 2023 09:46:38 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2023-06-12 13:59:53.757956
- Title: Transformer-based Time-to-Event Prediction for Chronic Kidney Disease
Deterioration
- Title(参考訳): トランスフォーマーを用いた慢性腎臓病の経時的予測
- Authors: Moshe Zisser and Dvir Aran
- Abstract要約: STRAFEは、電子健康記録のための一般化可能な生存分析変換器ベースのアーキテクチャである。
STRAFEの性能は,慢性腎臓病3段階の患者130,000人以上の実世界のクレームデータセットを用いて評価した。
STRAFE予測は高リスク患者の肯定的な予測値を3倍に改善し、介入プログラムのターゲティングを改善するための使用法を示す。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 0.0
- License: http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/
- Abstract: Deep-learning techniques, particularly the transformer model, have shown
great potential in enhancing the prediction performance of longitudinal health
records. While previous methods have mainly focused on fixed-time risk
prediction, time-to-event prediction (also known as survival analysis) is often
more appropriate for clinical scenarios. Here, we present a novel deep-learning
architecture we named STRAFE, a generalizable survival analysis
transformer-based architecture for electronic health records. The performance
of STRAFE was evaluated using a real-world claim dataset of over 130,000
individuals with stage 3 chronic kidney disease (CKD) and was found to
outperform other time-to-event prediction algorithms in predicting the exact
time of deterioration to stage 5. Additionally, STRAFE was found to outperform
binary outcome algorithms in predicting fixed-time risk, possibly due to its
ability to train on censored data. We show that STRAFE predictions can improve
the positive predictive value of high-risk patients by 3-fold, demonstrating
possible usage to improve targeting for intervention programs. Finally, we
suggest a novel visualization approach to predictions on a per-patient basis.
In conclusion, STRAFE is a cutting-edge time-to-event prediction algorithm that
has the potential to enhance risk predictions in large claims datasets.
- Abstract(参考訳): 深層学習技術、特にトランスフォーマーモデルは、縦断的健康記録の予測性能を高める大きな可能性を示している。
従来の手法は主に固定時間リスク予測に焦点を合わせてきたが、生存分析(time-to-event prediction)は臨床シナリオに適していることが多い。
本稿では、電子健康記録のための一般化可能な生存分析変換器アーキテクチャであるSTRAFEという新しいディープラーニングアーキテクチャを提案する。
ステージ3慢性腎臓病(ckd)患者13万人以上の実世界クレームデータセットを用いて評価を行い,ステージ5までの劣化時期の予測において,他の時間-事象予測アルゴリズムを上回った。
さらに、STRAFEは、おそらく検閲されたデータでトレーニングできるため、固定時間リスクを予測するためにバイナリ結果アルゴリズムよりも優れていることが判明した。
STRAFE予測は高リスク患者の3倍の正の予測値を3倍に改善し,介入プログラムのターゲティングの改善に有効であることを示す。
最後に,患者毎の予測に対する新しい可視化手法を提案する。
結論として、STRAFEは、大規模クレームデータセットにおけるリスク予測を強化する可能性を持つ最先端の時間対イベント予測アルゴリズムである。
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