論文の概要: Pseudo-Labeling Enhanced by Privileged Information and Its Application
to In Situ Sequencing Images
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2306.15898v1
- Date: Wed, 28 Jun 2023 03:44:42 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2023-06-29 15:54:12.912882
- Title: Pseudo-Labeling Enhanced by Privileged Information and Its Application
to In Situ Sequencing Images
- Title(参考訳): 特権情報による擬似ラベル化とそのin situシーケンシング画像への応用
- Authors: Marzieh Haghighi, Mario C. Cruz, Erin Weisbart, Beth A. Cimini, Avtar
Singh, Julia Bauman, Maria E. Lozada, Sanam L. Kavari, James T. Neal, Paul C.
Blainey, Anne E. Carpenter and Shantanu Singh
- Abstract要約: 本研究では,空間転写学において,半教師付き物体検出問題として重要な問題を提起する。
提案フレームワークは,情報ソースを半教師付き学習フレームワークに組み込む。
利用可能な特権情報は、データドメイン固有のものだが、擬似ラベルの一般的な戦略を導入している。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 0.9928479118868602
- License: http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
- Abstract: Various strategies for label-scarce object detection have been explored by
the computer vision research community. These strategies mainly rely on
assumptions that are specific to natural images and not directly applicable to
the biological and biomedical vision domains. For example, most semi-supervised
learning strategies rely on a small set of labeled data as a confident source
of ground truth. In many biological vision applications, however, the ground
truth is unknown and indirect information might be available in the form of
noisy estimations or orthogonal evidence. In this work, we frame a crucial
problem in spatial transcriptomics - decoding barcodes from In-Situ-Sequencing
(ISS) images - as a semi-supervised object detection (SSOD) problem. Our
proposed framework incorporates additional available sources of information
into a semi-supervised learning framework in the form of privileged
information. The privileged information is incorporated into the teacher's
pseudo-labeling in a teacher-student self-training iteration. Although the
available privileged information could be data domain specific, we have
introduced a general strategy of pseudo-labeling enhanced by privileged
information (PLePI) and exemplified the concept using ISS images, as well on
the COCO benchmark using extra evidence provided by CLIP.
- Abstract(参考訳): ラベル・スカース物体検出のための様々な戦略がコンピュータビジョン研究コミュニティによって検討されている。
これらの戦略は主に、自然画像に特有の仮定に依存しており、生物学的および生物医学的な視覚領域に直接適用されない。
例えば、ほとんどの半教師付き学習戦略は、信頼できる真実の情報源としてラベル付きデータの小さなセットに依存している。
しかし、多くの生物学的視覚応用において、基礎的真理は未知であり、間接的な情報はノイズ推定や直交的証拠という形で利用可能である。
本研究では,半教師付き物体検出(ssod)問題として,空間的トランスクリプトミクス(iss画像からバーコードを復号する)における重要な問題を考察する。
提案フレームワークは,半教師付き学習フレームワークに特権情報という形で追加可能な情報ソースを組み込む。
特権情報は教師の疑似ラベルに組み込まれ、教師の教師が自習するイテレーションで学習される。
利用可能な特権情報はデータドメインに特化することができるが、特権情報(PLePI)によって強化された擬似ラベルの一般的な戦略を導入し、ISSイメージとCLIPが提供する余分な証拠を用いたCOCOベンチマークを用いて概念を実証した。
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