論文の概要: tdCoxSNN: Time-Dependent Cox Survival Neural Network for Continuous-time
Dynamic Prediction
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2307.05881v2
- Date: Tue, 12 Mar 2024 14:09:56 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2024-03-14 02:06:15.660967
- Title: tdCoxSNN: Time-Dependent Cox Survival Neural Network for Continuous-time
Dynamic Prediction
- Title(参考訳): tdCoxSNN:連続時間動的予測のための時間依存コックス生存ニューラルネットワーク
- Authors: Lang Zeng, Jipeng Zhang, Wei Chen, Ying Ding
- Abstract要約: 本研究では,時間依存型Coxサバイバルニューラルネットワーク(tdCoxSNN)を提案する。
提案手法と共同モデリングおよびランドマーク手法を広範囲なシミュレーションにより評価・比較する。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 19.38247205641199
- License: http://arxiv.org/licenses/nonexclusive-distrib/1.0/
- Abstract: The aim of dynamic prediction is to provide individualized risk predictions
over time, which are updated as new data become available. In pursuit of
constructing a dynamic prediction model for a progressive eye disorder,
age-related macular degeneration (AMD), we propose a time-dependent Cox
survival neural network (tdCoxSNN) to predict its progression using
longitudinal fundus images. tdCoxSNN builds upon the time-dependent Cox model
by utilizing a neural network to capture the non-linear effect of
time-dependent covariates on the survival outcome. Moreover, by concurrently
integrating a convolutional neural network (CNN) with the survival network,
tdCoxSNN can directly take longitudinal images as input. We evaluate and
compare our proposed method with joint modeling and landmarking approaches
through extensive simulations. We applied the proposed approach to two real
datasets. One is a large AMD study, the Age-Related Eye Disease Study (AREDS),
in which more than 50,000 fundus images were captured over a period of 12 years
for more than 4,000 participants. Another is a public dataset of the primary
biliary cirrhosis (PBC) disease, where multiple lab tests were longitudinally
collected to predict the time-to-liver transplant. Our approach demonstrates
commendable predictive performance in both simulation studies and the analysis
of the two real datasets.
- Abstract(参考訳): 動的予測の目的は、新しいデータが利用可能になると更新される個人化されたリスク予測を時間とともに提供することである。
加齢黄斑変性症(amd)の進行眼疾患に対する動的予測モデルの構築のために,縦型眼底画像を用いてその進行を予測するための時間依存coxサバイバルニューラルネットワーク(tdcoxsnn)を提案する。
tdCoxSNNは、ニューラルネットワークを使用して、生存結果に対する時間依存共変体の非線形効果をキャプチャすることで、時間依存コックスモデルに基づいて構築される。
さらに、畳み込みニューラルネットワーク(CNN)とサバイバルネットワークを同時に統合することにより、tdCoxSNNは縦画像を直接入力として取り込むことができる。
提案手法と共同モデリングおよびランドマーク手法を広範囲なシミュレーションにより評価・比較する。
提案手法を2つの実データに適用した。
AREDS(Aage-Related Eye Disease Study、老化関連眼疾患研究)は、4000人以上の参加者に対して、12年間に5万枚以上の眼底画像が撮影された大規模なAMD研究である。
もうひとつは原発性胆汁性肝硬変(PBC)のデータセットで、複数の実験室で経時的に採取し、移植までの時間を予測する。
本手法は, シミュレーションと実データ解析の両方において, 予測性能が向上することを示す。
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